RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 OR2B2Q9GZK3 357 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 HOXD1Q9GZZ0 328 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF385DQ9H6B1 395 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 POPDC2Q9HBU9 364 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 SNX7Q9UNH6 387 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 USTQ9Y2C2 406 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 PRKAB1Q9Y478 270 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 TCAF1Q9Y4C2 921 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 SPEF1Q9Y4P9 236 aa8.94□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 LOC100653049A0A140TA62 436 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 A0A1B0GWJ7 208 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ARHGEF35A5YM69 484 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 SAC3D1A6NKF1 404 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 KPNA5O15131 536 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 CLN5O75503 358 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 KRT34O76011 436 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 MYO1DO94832 1006 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 OSBPP22059 807 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 SELENBP1Q13228 472 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 SLC36A3Q495N2 470 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 FGD3Q5JSP0 725 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 GALNT18Q6P9A2 607 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 PARP8Q8N3A8 854 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 TRIM63Q969Q1 353 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ZUFSPQ96AP4 578 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 CDCA5Q96FF9 252 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 FAM167AQ96KS9 214 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 TRIM15Q9C019 465 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 EVPLLA8MZ36 301 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 F8W810 466 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 VWA5AO00534 786 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 CYB561D2O14569 222 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 MEIS2O14770 477 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 GREM1O60565 184 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 KATNA1O75449 491 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 HPGDP15428 266 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 DNAJB2P25686 324 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 GRIK1P39086 918 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 PTPN9P43378 593 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 FSTL1Q12841 308 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 TRAF2Q12933 501 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 PMS2P3Q13401 168 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 TIGD2Q4W5G0 525 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 HACD2Q6Y1H2 254 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 IKBIPQ70UQ0 350 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 OTOP1Q7RTM1 612 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 IGDCC3Q8IVU1 814 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF786Q8N393 782 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 RDH13Q8NBN7 331 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 PIK3C3Q8NEB9 887 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 CPA5Q8WXQ8 436 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 PIGBQ92521 554 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 TP53INP1Q96A56 240 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 BTN2A3PQ96KV6 586 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 TM9SF2Q99805 663 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ADNPQ9H2P0 1102 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ANLNQ9NQW6 1124 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 GDAP2Q9NXN4 497 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 EHD3Q9NZN3 535 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ADAM28Q9UKQ2 775 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 TRAF6Q9Y4K3 522 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 AIM2O14862 343 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ZBTB14O43829 449 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 AVILO75366 819 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ICAM2P13598 275 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 KRT20P35900 424 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 HCAR3P49019 387 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 MS4A2Q01362 244 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 MERTKQ12866 999 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 MTMR2Q13614 643 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 PCLAFQ15004 111 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 PPM1LQ5SGD2 360 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF773Q6PK81 442 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 ERMP1Q7Z2K6 904 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 AKAP14Q86UN6 197 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 KSR1Q8IVT5 923 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 KLHL32Q96NJ5 620 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.93□□□□□ -0.98
GPBP1-208ENST00000514387 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms