RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513573.1

CDH18-AS1-201, CDH18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH18-AS1, Length 424 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CCKBRP32239 447 aa20.47■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GGCXP38435 758 aa20.47■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ADKP55263 362 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EFHC1Q5JVL4 640 aa20.47■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RAB11FIP2Q7L804 512 aa20.47■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PLPP6Q8IY26 295 aa20.47■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FBXO39Q8N4B4 442 aa20.47■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LRRC61Q9BV99 259 aa20.47■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TNKS2Q9H2K2 1166 aa20.47■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa20.47■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RABGEF1Q9UJ41 708 aa20.47■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa20.46■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa20.46■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CLEC18AA5D8T8 446 aa20.46■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IGLON5A6NGN9 336 aa20.46■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MED7O43513 233 aa20.46■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RHOCP08134 193 aa20.46■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FAM87AP0C7U9 286 aa20.46■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 YPEL5P62699 121 aa20.46■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLC20A2Q08357 652 aa20.46■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PRRT3Q5FWE3 981 aa20.46■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CLEC18BQ6UXF7 455 aa20.46■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LINGO4Q6UY18 593 aa20.46■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DTX1Q86Y01 620 aa20.46■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CLEC18CQ8NCF0 446 aa20.46■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NT5C3BQ969T7 300 aa20.46■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RAB7BQ96AH8 199 aa20.46■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C1orf74Q96LT6 269 aa20.46■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GSDMAQ96QA5 445 aa20.46■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CPXM1Q96SM3 734 aa20.46■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HEPHQ9BQS7 1158 aa20.46■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ANKMY1Q9P2S6 941 aa20.46■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 A0A1W2PQM1 296 aa20.45■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CD160O95971 181 aa20.45■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CXCR3P49682 368 aa20.45■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SGCGQ13326 291 aa20.45■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C1orf61Q13536 156 aa20.45■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PTK2BQ14289 1009 aa20.45■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TBR1Q16650 682 aa20.45■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LVRNQ6Q4G3 990 aa20.45■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PHACTR4Q8IZ21 702 aa20.45■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CEP63Q96MT8 703 aa20.45■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ACP6Q9NPH0 428 aa20.45■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RMND1Q9NWS8 449 aa20.45■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa20.45■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa20.44■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 D6RAR5 112 aa20.44■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TOR1BO14657 336 aa20.44■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ADCY5O95622 1261 aa20.44■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TSHRP16473 764 aa20.44■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ABL2P42684 1182 aa20.44■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CETN1Q12798 172 aa20.44■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PNOCQ13519 176 aa20.44■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CARD16Q5EG05 197 aa20.44■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 OLFML1Q6UWY5 402 aa20.44■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.44■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NPY6RQ99463 290 aa20.44■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa20.44■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SIK2Q9H0K1 926 aa20.44■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PIGVQ9NUD9 493 aa20.44■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 COX16Q9P0S2 106 aa20.44■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ILVBLA1L0T0 632 aa20.43■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 AREL1O15033 823 aa20.43■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ANXA6P08133 673 aa20.43■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 WT1P19544 449 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NOS2P35228 1153 aa20.43■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ARF5P84085 180 aa20.43■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BRMS1LQ5PSV4 323 aa20.43■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa20.43■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ARL10Q8N8L6 244 aa20.43■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.43■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLC25A18Q9H1K4 315 aa20.43■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DOCK4Q8N1I0 1966 aa20.43■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IGFALSP35858 605 aa20.42■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KRT85P78386 507 aa20.42■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TLE1Q04724 770 aa20.42■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NME3Q13232 169 aa20.42■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RETSATQ6NUM9 610 aa20.42■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.42■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MACC1Q6ZN28 852 aa20.42■□□□□ 0.86
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLC26A9Q7LBE3 791 aa20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.1 ms