RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 CDKAL1Q5VV42 579 aa17.21■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 KDM7AQ6ZMT4 941 aa17.21■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 LEKR1Q6ZMV7 388 aa17.21■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 STRADAQ7RTN6 431 aa17.21■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 PLPP6Q8IY26 295 aa17.21■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 CCDC185Q8N715 623 aa17.21■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 APOLD1Q96LR9 279 aa17.21■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 GPR27Q9NS67 375 aa17.21■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 TMEM248Q9NWD8 314 aa17.21■□□□□ 0.35
HERC3-211ENST00000513325 TRPM6Q9BX84 2022 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 NEMP2A6NFY4 417 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 IGLON5A6NGN9 336 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 C16orf96A6NNT2 1141 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 KRIT1O00522 736 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 BRINP1O60477 761 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 RAMP2O60895 175 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 NEBLO76041 1014 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 ALPPL2P10696 532 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 KRT3P12035 628 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 CKMT1AP12532 417 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 ABL2P42684 1182 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 HDAC4P56524 1084 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 PTP4A2Q12974 167 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 SGCGQ13326 291 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 FKBP15Q5T1M5 1219 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 TRIM72Q6ZMU5 477 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 FAM172AQ8WUF8 416 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 VOPP1Q96AW1 172 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 TBC1D31Q96DN5 1066 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 MAGEH1Q9H213 219 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 RETREG1Q9H6L5 497 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 NLGN3Q9NZ94 848 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 GGT7Q9UJ14 662 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 HPCAL4Q9UM19 191 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 NEU3Q9UQ49 428 aa17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 K7ESM1 405 aa17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 NEMP1O14524 444 aa17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 SCAMP1O15126 338 aa17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 RRP8O43159 456 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 TSPAN6O43657 245 aa17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 OPA1O60313 960 aa17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 GSRP00390 522 aa17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 UGT2B4P06133 528 aa17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 TPM2P07951 284 aa17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 STAT1P42224 750 aa17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 NSFP46459 744 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 ZNF805Q5CZA5 627 aa17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 OR2AP1Q8NGE2 309 aa17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 RAB7BQ96AH8 199 aa17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 FANCLQ9NW38 375 aa17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 ADAM22Q9P0K1 906 aa17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 ITM2BQ9Y287 266 aa17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 SIK3Q9Y2K2 1263 aa17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 BAHCC1Q9P281 2608 aa17.19■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 FPGTO14772 594 aa17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 KDELR3O43731 214 aa17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 POP4O95707 220 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 CSF2P04141 144 aa17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 NME1P15531 152 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 GPD1P21695 349 aa17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 RABIFP47224 123 aa17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 MYLK3Q32MK0 819 aa17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 TPRG1LQ5T0D9 272 aa17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 WDR59Q6PJI9 974 aa17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 ZSCAN30Q86W11 494 aa17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 PARGQ86W56 976 aa17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 FAM181AQ8N9Y4 354 aa17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 BAP1Q92560 729 aa17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 FGF11Q92914 225 aa17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 NTAN1Q96AB6 310 aa17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 KLHL32Q96NJ5 620 aa17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 DUSP23Q9BVJ7 150 aa17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 SELENOOQ9BVL4 669 aa17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 LMBRD1Q9NUN5 540 aa17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 KLF15Q9UIH9 416 aa17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 U3KQA8 63 aa17.18■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 H3BM21 787 aa17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.9 ms