RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP2-209ENST00000504450 C7orf26Q96N11 449 aa10.93□□□□□ -0.66
SH3BP2-209ENST00000504450 MAGEH1Q9H213 219 aa10.93□□□□□ -0.66
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SH3BP2-209ENST00000504450 SNX15Q9NRS6 342 aa10.93□□□□□ -0.66
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SH3BP2-209ENST00000504450 SPG21Q9NZD8 308 aa10.93□□□□□ -0.66
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SH3BP2-209ENST00000504450 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa10.93□□□□□ -0.66
SH3BP2-209ENST00000504450 GGT7Q9UJ14 662 aa10.93□□□□□ -0.66
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SH3BP2-209ENST00000504450 EYSQ5T1H1 3165 aa10.93□□□□□ -0.66
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SH3BP2-209ENST00000504450 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-209ENST00000504450 ACVR1CQ8NER5 493 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-209ENST00000504450 OR52K2Q8NGK3 314 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-209ENST00000504450 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-209ENST00000504450 WBP2Q969T9 261 aa10.92□□□□□ -0.66
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SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM169Q96HH4 297 aa10.92□□□□□ -0.66
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SH3BP2-209ENST00000504450 GPR22Q99680 433 aa10.92□□□□□ -0.66
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