RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 TM6SF2Q9BZW4 377 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 TNKS2Q9H2K2 1166 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 ETNK2Q9NVF9 386 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 HEY1Q9Y5J3 304 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 CKAP5Q14008 2032 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 KRIT1O00522 736 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 CST8O60676 142 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 SEMA4FO95754 770 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 VAV1P15498 845 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 ITGB7P26010 798 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 SERPINA4P29622 427 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 PEX5P50542 639 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 NEK3P51956 506 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 CYTH1Q15438 398 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF805Q5CZA5 627 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 ARSIQ5FYB1 569 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 LYSMD4Q5XG99 296 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 FBXL19Q6PCT2 694 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 GDPD4Q6W3E5 623 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 CPNE8Q86YQ8 564 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 NDUFAF2Q8N183 169 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 PAF1Q8N7H5 531 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 SUMF1Q8NBK3 374 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 SKA1Q96BD8 255 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 HES6Q96HZ4 224 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 HINFPQ9BQA5 517 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 OSBPL8Q9BZF1 889 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 MTG2Q9H4K7 406 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 PREBQ9HCU5 417 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 DTLQ9NZJ0 730 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 DKK3Q9UBP4 350 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1W2PP55 124 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 MFSD11O43934 449 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 LEFTY1O75610 366 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 EPN2O95208 641 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 APOC2P02655 101 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 XPAP23025 273 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 MMP13P45452 471 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 NUMBP49757 651 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 BCL2L1Q07817 233 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 XRCC4Q13426 336 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 RPS6KA1Q15418 735 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 KAZNQ674X7 775 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 BRAT1Q6PJG6 821 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 BBS12Q6ZW61 710 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 CYP2U1Q7Z449 544 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 SRLQ86TD4 932 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 MAML1Q92585 1016 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 VAT1Q99536 393 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC6A17Q9H1V8 727 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 NEUROG2Q9H2A3 272 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIM10Q9UDY6 481 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 WASF2Q9Y6W5 498 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 PRR23AA6NEV1 266 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 METTL12A8MUP2 240 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 MEI4A8MW99 385 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 AP1G1O43747 822 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 CCNB1P14635 433 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 CCR5P51681 352 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 GBE1Q04446 702 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 SYT12Q8IV01 421 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 TEX26Q8N6G2 289 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 OR14C36Q8NHC7 312 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 KRT35Q92764 455 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM131CQ96AQ9 280 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 ERLEC1Q96DZ1 483 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 FEM1CQ96JP0 617 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 NUDCD1Q96RS6 583 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 MGME1Q9BQP7 344 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 GPR174Q9BXC1 333 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 GOLPH3Q9H4A6 298 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 SCUBE2Q9NQ36 999 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 VPS45Q9NRW7 570 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 LHX3Q9UBR4 397 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-208ENST00000504294 INVSQ9Y283 1065 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms