RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498428.5

ROBO1-211, Transcript of roundabout guidance receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ROBO1, Length 3,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO1-211ENST00000498428 DYNLT1P63172 113 aa7.34□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 TUBA3CQ13748 450 aa7.34□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 TRIP10Q15642 601 aa7.34□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 SOWAHAQ2M3V2 549 aa7.34□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 KCNT2Q6UVM3 1135 aa7.34□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 ULK2Q8IYT8 1036 aa7.34□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 CALML6Q8TD86 181 aa7.34□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.34□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 EDEM1Q92611 657 aa7.34□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 APBB2Q92870 758 aa7.34□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 CNBD2Q96M20 576 aa7.34□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 RANBP9Q96S59 729 aa7.34□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 TMEM209Q96SK2 561 aa7.34□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 ELOVL4Q9GZR5 314 aa7.34□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 CDH19Q9H159 772 aa7.34□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 SDCBP2Q9H190 292 aa7.34□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 SIX2Q9NPC8 291 aa7.34□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa7.34□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 NAGPAQ9UK23 515 aa7.34□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 ADAM28Q9UKQ2 775 aa7.34□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 LAMA3Q16787 3333 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 J3QRK9 145 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 CIB2O75838 187 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 FDFT1P37268 417 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 NR1H2P55055 460 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 MGAT3Q09327 533 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 AADACL2Q6P093 401 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 FUT10Q6P4F1 479 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 XKR5Q6UX68 686 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 NT5DC3Q86UY8 548 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 ICA1LQ8NDH6 482 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 LINC01599Q8WXQ3 324 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 TFAP2BQ92481 460 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 FBXL8Q96CD0 374 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 B3GNT5Q9BYG0 378 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 GPR62Q9BZJ7 368 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 AAASQ9NRG9 546 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 PLK2Q9NYY3 685 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 TBX21Q9UL17 535 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 GOLGA8CPA6NN73 597 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 F8VP50 259 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 PSMD11O00231 422 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 DNAJA2O60884 412 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 FKBP6O75344 327 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 MICAL2O94851 1124 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 EOMESO95936 686 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 CYP2F1P24903 491 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 NUP107P57740 925 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 WDR5P61964 334 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 GCNT1Q02742 428 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 DUSP4Q13115 394 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 PPP2R5EQ16537 467 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 PDK4Q16654 411 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 SMTNL2Q2TAL5 461 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 GRAMD1BQ3KR37 738 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 C9orf50Q5SZB4 431 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 CORO6Q6QEF8 472 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 MIB1Q86YT6 1006 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 SHC3Q92529 594 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 HSPH1Q92598 858 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 TAMM41Q96BW9 452 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 MTBPQ96DY7 904 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 RUNDC3BQ96NL0 473 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 TOX2Q96NM4 488 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 KCNK16Q96T55 309 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 SIK2Q9H0K1 926 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF696Q9H7X3 374 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 GPAMQ9HCL2 828 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 POLG2Q9UHN1 485 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa7.33□□□□□ -1.24
ROBO1-211ENST00000498428 ARHGEF37A1IGU5 675 aa7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms