RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 CKAP2Q8WWK9 683 aa13.5□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 PIK3R5Q8WYR1 880 aa13.5□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 PLIN4Q96Q06 1357 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 CTPS1P17812 591 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 GPR1P46091 355 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 SMARCB1Q12824 385 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 CYP2R1Q6VVX0 501 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 OR52K2Q8NGK3 314 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 RIN3Q8TB24 985 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 ART4Q93070 314 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 ROGDIQ9GZN7 287 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 MAF1Q9H063 256 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 SLC28A3Q9HAS3 691 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 MAN1C1Q9NR34 630 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 A0A087X1B8 175 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 CCDC154A6NI56 674 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 ALOX15BO15296 676 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 PDE5AO76074 875 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 ITGA2BP08514 1039 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 DET1Q7L5Y6 550 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 SLC26A9Q7LBE3 791 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 CXorf40AQ8TE69 158 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 SKA1Q96BD8 255 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 BTN2A3PQ96KV6 586 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 BBS4Q96RK4 519 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 NDOR1Q9UHB4 597 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1W2PQH9 124 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 LBPP18428 481 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 PAX7P23759 505 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 PLPP4Q5VZY2 271 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 RAET1GQ6H3X3 334 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 MAGEC3Q8TD91 643 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 FNIP1Q8TF40 1166 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 KCTD4Q8WVF5 259 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 RERGLQ9H628 205 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 COMMD8Q9NX08 183 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 USE1Q9NZ43 259 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 LIMD1Q9UGP4 676 aa13.49□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 ANKDD1BA6NHY2 528 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 SAC3D1A6NKF1 404 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 RGS14O43566 566 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 PEX11AO75192 247 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 GSCP56915 257 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 NOMO1Q15155 1222 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 TEX44Q53QW1 395 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 FAM45BPQ6NSW5 357 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 SLC51AQ86UW1 340 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 CYP4Z1Q86W10 505 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 NAT16Q8N8M0 369 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 NKX2-3Q8TAU0 364 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 FAM45AQ8TCE6 357 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 COPS8Q99627 209 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 BTBD10Q9BSF8 475 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM245Q9H330 911 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 MORF4L1Q9UBU8 362 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 CHKBQ9Y259 395 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 EFR3BQ9Y2G0 817 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 STARD13Q9Y3M8 1113 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 ACTL7BQ9Y614 415 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 SNX3O60493 162 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 C1RP00736 705 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 NTRK1P04629 796 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 FGF1P05230 155 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 CDC25CP30307 473 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 RPS7P62081 194 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 DHFR2Q86XF0 187 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 XYLT1Q86Y38 959 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 SYT12Q8IV01 421 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 MREGQ8N565 214 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 GLOD4Q9HC38 313 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 GMIPQ9P107 970 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 ENO4A6NNW6 628 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 MEI4A8MW99 385 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 CA12O43570 354 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 PARNO95453 639 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 ABHD2P08910 425 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 FCGR1AP12314 374 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 LAG3P18627 525 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 TSPAN8P19075 237 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 SLC5A3P53794 718 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 MBTD1Q05BQ5 628 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 ATAD3BQ5T9A4 648 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 IZUMO2Q6UXV1 221 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 TNS4Q8IZW8 715 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 ACMSDQ8TDX5 336 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 MIEF2Q96C03 454 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 SH3GL2Q99962 352 aa13.48□□□□□ -0.25
HDLBP-241ENST00000487169 VPS45Q9NRW7 570 aa13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms