RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 HMGXB4Q9UGU5 601 aa13.64□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 SLC25A13Q9UJS0 675 aa13.64□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 ATRQ13535 2644 aa13.64□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 B4E171 279 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 ZW10O43264 779 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 MSI1O43347 362 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 ACSL4O60488 711 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 P4HA1P13674 534 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 TSPAN7P41732 249 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 STAT5AP42229 794 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 CDK18Q07002 472 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 SEMA5AQ13591 1074 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 DLG2Q15700 870 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 MACC1Q6ZN28 852 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM135Q86UB9 458 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 HID1Q8IV36 788 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 CFAP52Q8N1V2 620 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 NECAB1Q8N987 351 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 PNPLA2Q96AD5 504 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 RTP4Q96DX8 246 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 NUDT22Q9BRQ3 303 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 DUSP16Q9BY84 665 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 TRIM55Q9BYV6 548 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 TM6SF1Q9BZW5 370 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 SPRY4Q9C004 299 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 KIAA1586Q9HCI6 787 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 OCIAD1Q9NX40 245 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa13.63□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 ATP9BO43861 1147 aa13.62□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 SSTR2P30874 369 aa13.62□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 DLSTP36957 453 aa13.62□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 HK3P52790 923 aa13.62□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 YPEL5P62699 121 aa13.62□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 SLC12A1Q13621 1099 aa13.62□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 CEACAM20Q6UY09 585 aa13.62□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 ZSCAN30Q86W11 494 aa13.62□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 ESX1Q8N693 406 aa13.62□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 DENND6BQ8NEG7 585 aa13.62□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 RAD54LQ92698 747 aa13.62□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 CCDC127Q96BQ5 260 aa13.62□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 PPP1R16AQ96I34 528 aa13.62□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 CCDC114Q96M63 670 aa13.62□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 RANBP9Q96S59 729 aa13.62□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 HDAC8Q9BY41 377 aa13.62□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 TRIM8Q9BZR9 551 aa13.62□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 TWSG1Q9GZX9 223 aa13.62□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 VRTNQ9H8Y1 702 aa13.62□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 SLC26A4O43511 780 aa13.61□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 STK17BO94768 372 aa13.61□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 CTSLP07711 333 aa13.61□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 ALDH4A1P30038 563 aa13.61□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 CHRNA3P32297 505 aa13.61□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 LIMK2P53671 638 aa13.61□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 ITGA1P56199 1179 aa13.61□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 B4GALNT1Q00973 533 aa13.61□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 ART3Q13508 389 aa13.61□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 SLC6A19Q695T7 634 aa13.61□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 IQCKQ8N0W5 287 aa13.61□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 TMIEQ8NEW7 156 aa13.61□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 RASSF8Q8NHQ8 419 aa13.61□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 EDEM1Q92611 657 aa13.61□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 C8orf76Q96K31 380 aa13.61□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 ZPBPQ9BS86 351 aa13.61□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 MLXIPLQ9NP71 852 aa13.61□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 CHST11Q9NPF2 352 aa13.61□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa13.61□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 IGLON5A6NGN9 336 aa13.6□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 B4GAT1O43505 415 aa13.6□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 KATNA1O75449 491 aa13.6□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 RASGRP1O95267 797 aa13.6□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 ZBED1O96006 694 aa13.6□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 PRNPP04156 253 aa13.6□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 F8A1P23610 371 aa13.6□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 NFKBIAP25963 317 aa13.6□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 VASPP50552 380 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 NEK3P51956 506 aa13.6□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 OR1D5P58170 312 aa13.6□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 BIRC3Q13489 604 aa13.6□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 ALCAMQ13740 583 aa13.6□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 CHRNA6Q15825 494 aa13.6□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 NADSYN1Q6IA69 706 aa13.6□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 LINGO4Q6UY18 593 aa13.6□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 AZIN2Q96A70 460 aa13.6□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 MYEOVQ96EZ4 313 aa13.6□□□□□ -0.23
C9orf3-211ENST00000463372 CTRCQ99895 268 aa13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms