RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-222ENST00000449504 TRIM49P0CI25 452 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 TRIM49CP0CI26 452 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 ADRB3P13945 408 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 TCN2P20062 427 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 RRM1P23921 792 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 BLKP51451 505 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 DNA2P51530 1060 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 VAMP7P51809 220 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 AMPD3Q01432 767 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 ARHGAP44Q17R89 818 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 EFHC2Q5JST6 749 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 C1orf220Q5T0J3 134 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 BRAPQ7Z569 592 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 PIM3Q86V86 326 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 VPS36Q86VN1 386 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 GKN2Q86XP6 184 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 SLITRK4Q8IW52 837 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 CCDC13Q8IYE1 715 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 NRSN1Q8IZ57 195 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 OR52K2Q8NGK3 314 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 GOLGA5Q8TBA6 731 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 TMC2Q8TDI7 906 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 ART4Q93070 314 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 ALG14Q96F25 216 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 SLC39A13Q96H72 371 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 SLC45A3Q96JT2 553 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 SERPINB11Q96P15 392 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 HDAC8Q9BY41 377 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 BACH2Q9BYV9 841 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 EDEM3Q9BZQ6 932 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 MUC3BQ9H195 1237 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 BLZF1Q9H2G9 400 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 MAP10Q9P2G4 905 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 LRIT1Q9P2V4 623 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 IL36AQ9UHA7 158 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 TLR6Q9Y2C9 796 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 NBASA2RRP1 2371 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 RP1P56715 2156 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 ARHGAP10A1A4S6 786 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 TCAF2A6NFQ2 919 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 SNAP91O60641 907 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 GLB1P16278 677 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 ITGB7P26010 798 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 ALDH4A1P30038 563 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 HK3P52790 923 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 COPB1P53618 953 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 CENPCQ03188 943 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 PPP3CAQ08209 521 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 RABGAP1LQ5R372 815 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 TCTN3Q6NUS6 607 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 LVRNQ6Q4G3 990 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 ENPP7Q6UWV6 458 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 LINGO4Q6UY18 593 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 NYAP1Q6ZVC0 841 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 UNC13DQ70J99 1090 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 KDELC2Q7Z4H8 507 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 SPRED1Q7Z699 444 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 TAC4Q86UU9 113 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 SFTPA2Q8IWL1 248 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 TTC39CQ8N584 583 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 FAM46DQ8NEK8 389 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 IRGQQ8WZA9 623 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 FAM149B1Q96BN6 582 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 DHX58Q96C10 678 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 TBATAQ96M53 351 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 HAPLN3Q96S86 360 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 B3GNT4Q9C0J1 378 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 KBTBD4Q9NVX7 518 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 DMAC2Q9NW81 257 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 SLC39A1Q9NY26 324 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 DKK3Q9UBP4 350 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 APPL1Q9UKG1 709 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 ITM2BQ9Y287 266 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 C2CD3Q4AC94 2353 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 KCNU1A8MYU2 1149 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 B4DGG1 531 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-222ENST00000449504 B4GAT1O43505 415 aa7.3□□□□□ -1.24
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