RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 RAMP2O60895 175 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 TPM2P07951 284 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 RHOQP17081 205 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 ETFBP38117 255 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 STAT1P42224 750 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 PTPN9P43378 593 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 NSFP46459 744 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 HDAC4P56524 1084 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 E2F1Q01094 437 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 SGCGQ13326 291 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 FZD2Q14332 565 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 RTP5Q14D33 572 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 SYCP1Q15431 976 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 FKBP15Q5T1M5 1219 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 KDM7AQ6ZMT4 941 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 TRIM72Q6ZMU5 477 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM172AQ8WUF8 416 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 RFFLQ8WZ73 363 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 TBC1D31Q96DN5 1066 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 BMFQ96LC9 184 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 NRSN2Q9GZP1 204 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 LMBRD1Q9NUN5 540 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 FANCLQ9NW38 375 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 ADAM22Q9P0K1 906 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 GGT7Q9UJ14 662 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 ITM2BQ9Y287 266 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 K7ESM1 405 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 SCAMP1O15126 338 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 SPINT1O43278 529 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 TSPAN6O43657 245 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 AP1G1O43747 822 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 KALRNO60229 2985 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 OPA1O60313 960 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 BRINP1O60477 761 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 NEBLO76041 1014 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 MT-CO3P00414 261 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 UGT2B4P06133 528 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 GIMD1P0DJR0 217 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 ALPPL2P10696 532 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 KRT3P12035 628 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 CKMT1AP12532 417 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 UNGP13051 313 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 ABL2P42684 1182 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 ABCG1P45844 678 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 COPB1P53618 953 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 PTP4A2Q12974 167 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 ACAP1Q15027 740 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 MYLK3Q32MK0 819 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF805Q5CZA5 627 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 TPRG1LQ5T0D9 272 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR59Q6PJI9 974 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 STRADAQ7RTN6 431 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF354CQ86Y25 554 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 PYROXD2Q8N2H3 581 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 NETO2Q8NC67 525 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 VOPP1Q96AW1 172 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 IFT43Q96FT9 208 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 APOLD1Q96LR9 279 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 MAGEH1Q9H213 219 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 GPR27Q9NS67 375 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM248Q9NWD8 314 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 NLGN3Q9NZ94 848 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 HPCAL4Q9UM19 191 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 NEU3Q9UQ49 428 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 SIK3Q9Y2K2 1263 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 DOCK4Q8N1I0 1966 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 NEMP2A6NFY4 417 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 FPGTO14772 594 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 BUB1O43683 1085 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 KDELR3O43731 214 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 TMCC1O94876 653 aa10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms