RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 ATAD3BQ5T9A4 648 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT39Q6A163 491 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TMC5Q6UXY8 1006 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 C4orf22Q6V702 233 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP2R1Q6VVX0 501 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 OFCC1Q8IZS5 231 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PGAM4Q8N0Y7 254 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF781Q8N8C0 355 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ABHD11Q8NFV4 315 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TNIP2Q8NFZ5 429 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 FEZF2Q8TBJ5 459 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 FEM1CQ96JP0 617 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF347Q96SE7 839 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 HOXD1Q9GZZ0 328 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TUFT1Q9NNX1 390 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PARVAQ9NVD7 372 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TMX2Q9Y320 296 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 KMOO15229 486 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 VAPBO95292 243 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PCNAP12004 261 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CAP2P40123 477 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 GPC3P51654 580 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS6P62753 249 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 DGKDQ16760 1214 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 QRICH1Q2TAL8 776 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 FAXCQ5TGI0 409 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 HMBOX1Q6NT76 420 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CHSY3Q70JA7 882 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 IFNL1Q8IU54 200 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TTC39CQ8N584 583 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC10A4Q96EP9 437 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 NPAS2Q99743 824 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 C17orf80Q9BSJ5 609 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM96AQ9H5X1 160 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TCF7L2Q9NQB0 619 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 GDAP2Q9NXN4 497 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TXNDC16Q9P2K2 825 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ZHX2Q9Y6X8 837 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PCM1Q15154 2024 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ILVBLA1L0T0 632 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 AURKAO14965 403 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 GCATO75600 419 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 LYPLA2O95372 231 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PAHP00439 452 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CXCR2P25025 360 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 NOS2P35228 1153 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF76P36508 570 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CLCQ05315 142 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF846Q147U1 533 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNT1Q5JUK3 1230 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TTC23LQ6PF05 361 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC38A6Q8IZM9 456 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXL13Q8NEE6 735 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CYGBQ8WWM9 190 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 FAF2Q96CS3 445 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXL20Q96IG2 436 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 VCPIP1Q96JH7 1222 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 MCEEQ96PE7 176 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 MORF4L1Q9UBU8 362 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF229Q9UJW7 825 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ENPP3O14638 875 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PGRP06401 933 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 RALBP11234 206 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TGM1P22735 817 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SNAP25P60880 206 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TNK2Q07912 1038 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 NFIAQ12857 509 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PTK2BQ14289 1009 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 UBE2UQ5VVX9 321 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM180BQ6P0A1 224 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 EPGNQ6UW88 154 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR23BQ6ZRT6 265 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 AKAP14Q86UN6 197 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 HEATR4Q86WZ0 1026 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 C7orf57Q8NEG2 295 aa8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms