RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419364.1

SIX3-AS1-201, SIX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SIX3-AS1, Length 844 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RASA4BC9J798 803 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KRIT1O00522 736 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RASA4O43374 803 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RNF8O76064 485 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMCC1O94876 653 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DKK1O94907 266 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GKP32189 559 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TPI1P60174 286 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FANCCQ00597 558 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RAD51Q06609 339 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SERINC3Q13530 473 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MYLK3Q32MK0 819 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMEM259Q4ZIN3 620 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF805Q5CZA5 627 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SEL1L3Q68CR1 1132 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LUZP1Q86V48 1076 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZSCAN30Q86W11 494 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DNAAF5Q86Y56 855 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 OR6K2Q8NGY2 324 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FAM174AQ8TBP5 190 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RAB7BQ96AH8 199 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TRIM11Q96F44 468 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HMCESQ96FZ2 354 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MYOCQ99972 504 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FZD3Q9NPG1 666 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AP4E1Q9UPM8 1137 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CA5BQ9Y2D0 317 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SCINQ9Y6U3 715 aa13.58□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C16orf96A6NNT2 1141 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NEMP1O14524 444 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ENC1O14682 589 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TSPAN6O43657 245 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 THEGLP0DJG4 465 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MYBL1P10243 752 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SKILP12757 684 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PTMSP20962 102 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NDST2P52849 883 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 UBASH3AP57075 661 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RHOAP61586 193 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BNIP3Q12983 259 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCDC157Q569K6 752 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ERMARDQ5T6L9 678 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EID2Q8N6I1 236 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FNIP1Q8TF40 1166 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF653Q96CK0 615 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NCAPGQ9BPX3 1015 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC17A9Q9BYT1 436 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KLC2Q9H0B6 622 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PCSK1NQ9UHG2 260 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DOCK4Q8N1I0 1966 aa13.57□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 A0A1W2PQJ5 194 aa13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 A6NNZ2 444 aa13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DAPK3O43293 454 aa13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PRPSAP2O60256 369 aa13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IGSF6O95976 241 aa13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 UGT2B4P06133 528 aa13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CLDN2P57739 230 aa13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SGCGQ13326 291 aa13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GDPD4Q6W3E5 623 aa13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GALNT15Q8N3T1 639 aa13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 OR13H1Q8NG92 308 aa13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARHGEF26Q96DR7 871 aa13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KLHL32Q96NJ5 620 aa13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CALN1Q9BXU9 219 aa13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TRIM7Q9C029 511 aa13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ISCUQ9H1K1 167 aa13.56□□□□□ -0.24
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LRRC19Q9H756 370 aa13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms