RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417339.2

CENPVL3-201, Transcript of centromere protein V like 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CENPVL3, Length 864 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL3-201ENST00000417339 LRRC10BA6NIK2 292 aa21.81■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 SIGLEC16A6NMB1 481 aa21.81■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 OGDHQ02218 1023 aa21.81■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 PROX2Q3B8N5 592 aa21.81■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 LRRC73Q5JTD7 316 aa21.81■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 SCYL2Q6P3W7 929 aa21.81■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 FBXL19Q6PCT2 694 aa21.81■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 BAP1Q92560 729 aa21.81■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 NTAN1Q96AB6 310 aa21.81■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 PPP1R16AQ96I34 528 aa21.81■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 MCEEQ96PE7 176 aa21.81■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 SLC17A9Q9BYT1 436 aa21.81■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 KLHL11Q9NVR0 708 aa21.81■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 LAMA5O15230 3695 aa21.81■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 FFAR2O15552 330 aa21.8■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 SPINT1O43278 529 aa21.8■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 RAMP2O60895 175 aa21.8■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 CALB1P05937 261 aa21.8■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 GIMD1P0DJR0 217 aa21.8■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 JUPP14923 745 aa21.8■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 ITIH2P19823 946 aa21.8■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 DGKAP23743 735 aa21.8■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 CCDC15Q0P6D6 951 aa21.8■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 COL28A1Q2UY09 1125 aa21.8■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 TPRG1LQ5T0D9 272 aa21.8■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 HES3Q5TGS1 186 aa21.8■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 Q6ZSR6 202 aa21.8■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa21.8■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 SLFN11Q7Z7L1 901 aa21.8■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 TMPRSS12Q86WS5 348 aa21.8■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 MAGEH1Q9H213 219 aa21.8■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa21.8■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 IGLON5A6NGN9 336 aa21.79■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 C16orf96A6NNT2 1141 aa21.79■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 KRIT1O00522 736 aa21.79■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 KDELR3O43731 214 aa21.79■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 UGT2B4P06133 528 aa21.79■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 CKMT2P17540 419 aa21.79■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 TYRO3Q06418 890 aa21.79■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa21.79■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 DNAJC24Q6P3W2 148 aa21.79■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa21.79■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa21.79■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 TMEM63CQ9P1W3 806 aa21.79■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 RP1P56715 2156 aa21.79■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 INSIG1O15503 277 aa21.78■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 BUB1O43683 1085 aa21.78■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 CREB3O43889 395 aa21.78■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 PIAS2O75928 621 aa21.78■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 EPHB2P29323 1055 aa21.78■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 RPS21P63220 83 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 MYLK3Q32MK0 819 aa21.78■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 CCDC183Q5T5S1 534 aa21.78■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa21.78■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 ZNF354CQ86Y25 554 aa21.78■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 MCOLN2Q8IZK6 566 aa21.78■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 OR2AP1Q8NGE2 309 aa21.78■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 HMCESQ96FZ2 354 aa21.78■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 FEM1CQ96JP0 617 aa21.78■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 KLHL32Q96NJ5 620 aa21.78■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 DKK4Q9UBT3 224 aa21.78■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 FZD10Q9ULW2 581 aa21.78■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 TMCO5BA8MYB1 307 aa21.77■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 TMCC1O94876 653 aa21.77■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 GSRP00390 522 aa21.77■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 C1SP09871 688 aa21.77■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 ETFBP38117 255 aa21.77■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 FZD2Q14332 565 aa21.77■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 ZNF805Q5CZA5 627 aa21.77■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 ACAD10Q6JQN1 1059 aa21.77■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa21.77■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 TMC6Q7Z403 805 aa21.77■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 PLPP6Q8IY26 295 aa21.77■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 CRELD1Q96HD1 420 aa21.77■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 SYT11Q9BT88 431 aa21.77■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 GPR27Q9NS67 375 aa21.77■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 KLF15Q9UIH9 416 aa21.77■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 HPCAL4Q9UM19 191 aa21.77■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa21.77■■□□□ 1.08
CENPVL3-201ENST00000417339 A6NNZ2 444 aa21.76■■□□□ 1.07
CENPVL3-201ENST00000417339 RASA4BC9J798 803 aa21.76■■□□□ 1.07
CENPVL3-201ENST00000417339 RASA4O43374 803 aa21.76■■□□□ 1.07
CENPVL3-201ENST00000417339 AP1G1O43747 822 aa21.76■■□□□ 1.07
CENPVL3-201ENST00000417339 NEBLO76041 1014 aa21.76■■□□□ 1.07
CENPVL3-201ENST00000417339 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CENPVL3-201ENST00000417339 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CENPVL3-201ENST00000417339 EFHC2Q5JST6 749 aa21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms