RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 C17orf80Q9BSJ5 609 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 WACQ9BTA9 647 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 AMFRQ9UKV5 643 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 KIF3AQ9Y496 699 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 BRWD1Q9NSI6 2320 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 ANK1P16157 1881 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 TRANK1O15050 2925 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 ELP1O95163 1332 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 A0A1W2PPL8 197 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 BTN3A1O00481 513 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 MSH4O15457 936 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 SLC37A4O43826 429 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 LGALS2P05162 132 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 CYP3A4P08684 503 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 TGFB3P10600 412 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 MARK3P27448 753 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 IL1R2P27930 398 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 GKP32189 559 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 RGS19P49795 217 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 ACTR2P61160 394 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 PSG6Q00889 435 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 TLE2Q04725 743 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 CTBP1Q13363 440 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 ITGA7Q13683 1181 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 MLC1Q15049 377 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 KIAA0753Q2KHM9 967 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 METTL7BQ6UX53 244 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 B3GNT9Q6UX72 402 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 NIPA1Q7RTP0 329 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 SIRT6Q8N6T7 355 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 PPTC7Q8NI37 304 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF398Q8TD17 642 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 TMEM171Q8WVE6 324 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 CRYGNQ8WXF5 182 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 COQ8BQ96D53 544 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 CDHR1Q96JP9 859 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 TAAR9Q96RI9 348 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF577Q9BSK1 485 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 SMURF2Q9HAU4 748 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 SLC9A2Q9UBY0 812 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 Q9Y3F1 56 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 TTC3P53804 2025 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 GRIN2DO15399 1336 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 NFASCO94856 1347 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 E2F8A0AVK6 867 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 H0YGN5 161 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 SOCS2O14508 198 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 FCHO1O14526 889 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 EDIL3O43854 480 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 CABYRO75952 493 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 CCNE2O96020 404 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 CAPN2P17655 700 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 BCAT1P54687 386 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 SETQ01105 290 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 MCL1Q07820 350 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 CUL4AQ13619 759 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 RAB32Q13637 225 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 FHL1Q13642 323 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 NCAPH2Q6IBW4 605 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 MIER3Q7Z3K6 550 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 NANOGP1Q8N7R0 232 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 PPP1R35Q8TAP8 253 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 KAT2BQ92831 832 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 PPP2R3CQ969Q6 453 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 SNX21Q969T3 373 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 SENP7Q9BQF6 1050 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 EFHD1Q9BUP0 239 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 TEKT3Q9BXF9 490 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 TRPV6Q9H1D0 765 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 UNC45AQ9H3U1 944 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 AZI2Q9H6S1 392 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 HDAC6Q9UBN7 1215 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-209ENST00000415046 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms