RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384479.1

RNU6-790P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 790, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-790P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-790P-201ENST00000384479 LIASO43766 372 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 PPP1R3DO95685 299 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ADAP00813 363 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 FCGR1AP12314 374 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 CTPS1P17812 591 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 TTKP33981 857 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 THPOP40225 353 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ART1P52961 327 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ECT2LQ008S8 904 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 GRAMD1BQ3KR37 738 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZNF585BQ52M93 769 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 NADSYN1Q6IA69 706 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ANKRD44Q8N8A2 993 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 SMRP1Q8NCR6 262 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 AFG1LQ8WV93 481 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 TBC1D20Q96BZ9 403 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ARPC5LQ9BPX5 153 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 CLSTN3Q9BQT9 956 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 TM6SF1Q9BZW5 370 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 CXorf56Q9H5V9 222 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ACAD9Q9H845 621 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 PTPRHQ9HD43 1115 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ANKRD10Q9NXR5 420 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 NLKQ9UBE8 527 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 SUFUQ9UMX1 484 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 A0A0U1RQJ8 604 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 VWA3AA6NCI4 1184 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 CBY3A6NI87 242 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 KRT86O43790 486 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 PRSS2P07478 247 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZNF12P17014 697 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 MT3P25713 68 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 RYKP34925 604 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 PCYT1AP49585 367 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 PMS2P54278 862 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 KRT81Q14533 505 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 LPIN1Q14693 890 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 SLC18A3Q16572 532 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ME3Q16798 604 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 AP5B1Q2VPB7 878 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 SH2D4BQ5SQS7 431 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ATG9BQ674R7 924 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 NEK10Q6ZWH5 1172 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 DENND6AQ8IWF6 608 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 OR14A16Q8NHC5 309 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 RAB40AQ8WXH6 277 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 CCT6BQ92526 530 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 SNAPC3Q92966 411 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 SLC25A33Q9BSK2 321 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 CTDSP1Q9GZU7 261 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 CDT1Q9H211 546 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 CNPY2Q9Y2B0 182 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 BTBD18B2RXH4 712 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 TAF4O00268 1085 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 CHL1O00533 1208 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 SLC16A5O15375 505 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 GAGE7O76087 117 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 IL1AP01583 271 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 GAGE12FP0CL80 117 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 GAGE12GP0CL81 117 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 GAGE12IP0CL82 117 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 HSD3B1P14060 373 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 DAOP14920 347 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 PTPN2P17706 415 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 GPD2P43304 727 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 MXI1P50539 228 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ARSFP54793 590 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 GAS1P54826 345 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 POU5F1BQ06416 359 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 GAGE1Q13065 139 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 GAGE4Q13068 117 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 TRAF3Q13114 568 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 PPFIA1Q13136 1202 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 WDR45BQ5MNZ6 344 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-790P-201ENST00000384479 ANKRD45Q5TZF3 282 aa2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms