RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 LRRC40Q9H9A6 602 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 PSMD3O43242 534 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 USP12O75317 370 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 GRIA1P42261 906 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 SCNN1BP51168 640 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 MESP2Q0VG99 397 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 OLIG2Q13516 323 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 SLMAPQ14BN4 828 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 PCSK7Q16549 785 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 FNBP1LQ5T0N5 605 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 KCTD11Q693B1 232 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 ARRDC2Q8TBH0 407 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 SORCS1Q8WY21 1168 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 TTC17Q96AE7 1141 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 FSD1LQ9BXM9 530 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 SCUBE2Q9NQ36 999 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 LHX3Q9UBR4 397 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 HS3ST2Q9Y278 367 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 AVILO75366 819 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 MMP2P08253 660 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 SRCP12931 536 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 OPRD1P41143 372 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 MPP3Q13368 585 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 BBS9Q3SYG4 887 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 ALG1LQ6GMV1 187 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 TM6SF2Q9BZW4 377 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 SAYSD1Q9NPB0 183 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 THEGQ9P2T0 379 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 COL6A3P12111 3177 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 BANF1O75531 89 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 SUN1O94901 812 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 ACCSLQ4AC99 568 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF534Q76KX8 674 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 KDELC2Q7Z4H8 507 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 APOL2Q9BQE5 337 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 FICDQ9BVA6 458 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 NOD2Q9HC29 1040 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 VPS45Q9NRW7 570 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 ERVW-1Q9UQF0 538 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 INSIG1O15503 277 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 PPFIA2O75334 1257 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 SERPINF2P08697 491 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 SOX9P48436 509 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 WNT3AP56704 352 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 SKOR1P84550 965 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 MSS51Q4VC12 460 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 ZBED8Q8IZ13 594 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 DNAAF3Q8N9W5 541 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 OR52K1Q8NGK4 314 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 NUDCD1Q96RS6 583 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 TBL1YQ9BQ87 522 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 TNKS2Q9H2K2 1166 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 PRRT4C9JH25 899 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 ASLP04424 464 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 CR2P20023 1033 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 PMS2P54278 862 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 C22orf39Q6P5X5 142 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 LRRC8BQ6P9F7 803 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 KDELC1Q6UW63 502 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 LINC00523Q86TU6 105 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 TERB1Q8NA31 727 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 MRGPRX2Q96LB1 330 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 ELOVL2Q9NXB9 296 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 TBC1D3BA6NDS4 549 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 LOC730098B7Z3J9 87 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 AGTP01019 485 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 DLDP09622 509 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 CES1P23141 567 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 NNMTP40261 264 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 IHHQ14623 411 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 DGKKQ5KSL6 1271 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 CHFRQ96EP1 664 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 TXLNGYQ9BZA5 131 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXA4-201ENST00000360046 ANKRD36A6QL64 1941 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXA4-201ENST00000360046 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
HOXA4-201ENST00000360046 NARSO43776 548 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXA4-201ENST00000360046 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXA4-201ENST00000360046 BNIP3LO60238 219 aa22.14■■□□□ 1.13
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