RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 ZFP42Q96MM3 310 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 GPR78Q96P69 363 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 MRGBPQ9NV56 204 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM30AQ9NV96 361 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 SLC38A7Q9NVC3 462 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 MYBPHLA2RUH7 354 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 HHLA1C9JL84 531 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 DNAJA2O60884 412 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 PGK1P00558 417 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CCNCP24863 283 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 HSPA13P48723 471 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 PKNOX1P55347 436 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 MPP1Q00013 466 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 LDLRAD1Q5T700 205 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 KDM1BQ8NB78 822 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 FCRL5Q96RD9 977 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 A0A087X1B8 175 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CFLARO15519 480 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 VAPBO95292 243 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 SMIM18P0DKX4 95 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 PMLP29590 882 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CYP2C18P33260 490 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 PGGT1BP53609 377 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 POU6F1Q14863 301 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 POTEHQ6S545 545 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 TAC4Q86UU9 113 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 TICAM1Q8IUC6 712 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CEP97Q8IW35 865 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 DENND6AQ8IWF6 608 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 ATPAF2Q8N5M1 289 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 SPATA22Q8NHS9 363 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 USP33Q8TEY7 942 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CDH9Q9ULB4 789 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 DFFAO00273 331 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 TREHO43280 583 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CTBP1Q13363 440 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF460Q14592 562 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 SH2D4BQ5SQS7 431 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 TSTD2Q5T7W7 516 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CCNYL1Q8N7R7 359 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 IPMKQ8NFU5 416 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 NXNL1Q96CM4 212 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 MARK4Q96L34 752 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 OSBPL2Q9H1P3 480 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 TCAF2A6NFQ2 919 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 PAMP19021 973 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 ARNTP27540 789 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 DPP6P42658 865 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 DNAJB13P59910 316 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 SATL1Q86VE3 508 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 MFSD6LQ8IWD5 586 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 CEP70Q8NHQ1 597 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 RNF34Q969K3 372 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 SLC10A4Q96EP9 437 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 CLIC5Q9NZA1 410 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 NEU3Q9UQ49 428 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 TCAF1Q9Y4C2 921 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 SDHDO14521 159 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 CRTAMO95727 393 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 SLC1A2P43004 574 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 CD151P48509 253 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 PSEN2P49810 448 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 GEMP55040 296 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 MS4A2Q01362 244 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 ELMO2Q96JJ3 720 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 IL12RB2Q99665 862 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 FICDQ9BVA6 458 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM62Q9BVG3 475 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 GLOD4Q9HC38 313 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 PLK2Q9NYY3 685 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 AP4B1Q9Y6B7 739 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS3-201ENST00000355530 ACOT8O14734 319 aa18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms