RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354376.3

C9orf163-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 163, humanhuman

Gene C9orf163, Length 2,572 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163-201ENST00000354376 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 ADAM12O43184 909 aa22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 DLG1Q12959 904 aa22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 KDELC1Q6UW63 502 aa22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 MCUR1Q96AQ8 359 aa22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 ZYG11BQ9C0D3 744 aa22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 RHOJQ9H4E5 214 aa22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 MARCH2Q9P0N8 246 aa22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 CSRP3P50461 194 aa22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 NOGQ13253 232 aa22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 PEX6Q13608 980 aa22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 ANO4Q32M45 955 aa22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 RABGAP1LQ5R372 815 aa22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 CFAP52Q8N1V2 620 aa22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 PGBD5Q8N414 524 aa22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 CAPNS2Q96L46 248 aa22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.84■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 DOCK4Q8N1I0 1966 aa22.83■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 PSMD3O43242 534 aa22.83■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 WFS1O76024 890 aa22.83■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 SERPINA6P08185 405 aa22.83■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 MMP2P08253 660 aa22.83■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 ACVRL1P37023 503 aa22.83■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 HARS2P49590 506 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 KCNQ1P51787 676 aa22.83■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 FAM219BQ5XKK7 198 aa22.83■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 ZNF470Q6ECI4 717 aa22.83■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.83■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 PPP4R1Q8TF05 950 aa22.83■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 NDNQ99608 321 aa22.83■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 OMDQ99983 421 aa22.83■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
C9orf163-201ENST00000354376 ARVCFO00192 962 aa22.83■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 NADSYN1Q6IA69 706 aa22.83■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 CNSTQ6PJW8 725 aa22.83■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa22.83■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 SCYL1Q96KG9 808 aa22.83■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 CREBZFQ9NS37 354 aa22.83■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 TREX1Q9NSU2 369 aa22.83■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 C15orf41Q9Y2V0 281 aa22.83■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 KCTD3Q9Y597 815 aa22.83■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 PLXNA3P51805 1871 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 SYN3O14994 580 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 HSPA4LO95757 839 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 TPBGLP0DKB5 382 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 SELPP16109 830 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 GRK2P25098 689 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 ACSBG2Q5FVE4 666 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 FAM91A1Q658Y4 838 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 NXNL1Q96CM4 212 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 SGF29Q96ES7 293 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 SCLYQ96I15 445 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 TUBB6Q9BUF5 446 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 TLK1Q9UKI8 766 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 SIN3BO75182 1162 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 PGM1P36871 562 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 FUT10Q6P4F1 479 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 COG4Q9H9E3 785 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 IL37Q9NZH6 218 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 TAGLN3Q9UI15 199 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 WASH4PA8MWX3 477 aa22.81■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 BUD23O43709 281 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 ALDH2P05091 517 aa22.81■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 RHOQP17081 205 aa22.81■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 MPSTP25325 297 aa22.81■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 HTR7P34969 479 aa22.81■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 PTPRCAPQ14761 206 aa22.81■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 DBN1Q16643 649 aa22.81■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 RNF217Q8TC41 542 aa22.81■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 SP110Q9HB58 689 aa22.81■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 TMEM248Q9NWD8 314 aa22.81■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 ZNF212Q9UDV6 495 aa22.81■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms