RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRFP11831 508 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 CTHP32929 405 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 GALK1P51570 392 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 MPP3Q13368 585 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 E2F5Q15329 346 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUDCD1Q96RS6 583 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 TM6SF2Q9BZW4 377 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSPYL1Q9H0U9 437 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC40Q9H9A6 602 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 HEBP1Q9NRV9 189 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 VPS45Q9NRW7 570 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 LHX3Q9UBR4 397 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 GOLGA8MH3BSY2 632 aa27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 AP2A1O95782 977 aa27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGSF6O95976 241 aa27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 SERPINF2P08697 491 aa27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 NIPAL4Q0D2K0 466 aa27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 MESP2Q0VG99 397 aa27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 DLG2Q15700 870 aa27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALG1LQ6GMV1 187 aa27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 C22orf39Q6P5X5 142 aa27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEP128Q6ZU80 1094 aa27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF135Q8IUD6 432 aa27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 FSD1LQ9BXM9 530 aa27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 FOXP3Q9BZS1 431 aa27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa27.81■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa27.8■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 INSIG1O15503 277 aa27.8■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 NARSO43776 548 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 PMPCBO75439 489 aa27.8■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 GLULP15104 373 aa27.8■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 VASPP50552 380 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 RALGPS1Q5JS13 557 aa27.8■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 MCUQ8NE86 351 aa27.8■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 IPMKQ8NFU5 416 aa27.8■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARRDC2Q8TBH0 407 aa27.8■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 NEUROG2Q9H2A3 272 aa27.8■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa27.8■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP9BO43861 1147 aa27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM63AO94886 807 aa27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYBL2P10244 700 aa27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 ECHS1P30084 290 aa27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAPK8P45983 427 aa27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARL4CP56559 192 aa27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZP2Q05996 745 aa27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 DGKKQ5KSL6 1271 aa27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRLQ86TD4 932 aa27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC00523Q86TU6 105 aa27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 MSANTD3Q96H12 275 aa27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRGPRX3Q96LB0 322 aa27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 GORASP1Q9BQQ3 440 aa27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNKS2Q9H2K2 1166 aa27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 NOD2Q9HC29 1040 aa27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 COL4A3Q01955 1670 aa27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC151A5D8V7 595 aa27.78■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 TP73O15350 636 aa27.78■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 BNIP3LO60238 219 aa27.78■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 CR2P20023 1033 aa27.78■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNFRSF4P43489 277 aa27.78■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 RGRP47804 291 aa27.78■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 AP1S1P61966 158 aa27.78■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCSK7Q16549 785 aa27.78■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC25Q86WR0 208 aa27.78■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2AP1Q8NGE2 309 aa27.78■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa27.78■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 GSRP00390 522 aa27.77■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 CSNK1DP48730 415 aa27.77■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 WNT3AP56704 352 aa27.77■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 SKOR1P84550 965 aa27.77■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAD51Q06609 339 aa27.77■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPARCL1Q14515 664 aa27.77■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 HIF1AQ16665 826 aa27.77■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTPRNQ16849 979 aa27.77■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCTD11Q693B1 232 aa27.77■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDIK1LQ8N165 341 aa27.77■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 KDM1BQ8NB78 822 aa27.77■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFT43Q96FT9 208 aa27.77■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 SUN1O94901 812 aa27.77■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 MMP2P08253 660 aa27.77■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 CA4P22748 312 aa27.77■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP27.77■■■□□ 2.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC14A2Q15849 920 aa27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms