RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316843.8

LLGL1-201, Transcript of LLGL1, scribble cell polarity complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LLGL1, Length 4,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL1-201ENST00000316843 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 TLE6Q9H808 572 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 DNAJC28Q9NX36 388 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 PSMD13Q9UNM6 376 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 LZTS1Q9Y250 596 aa14.59□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 E5RI56 91 aa14.58□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 ZBTB14O43829 449 aa14.58□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 GRIA3P42263 894 aa14.58□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 RTKNQ9BST9 563 aa14.58□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 ING2Q9H160 280 aa14.58□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 MID1IP1Q9NPA3 183 aa14.58□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
LLGL1-201ENST00000316843 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 RHOBTB1O94844 696 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 DAOAP59103 153 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 MGAT5BQ3V5L5 792 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 CRYBG2Q8N1P7 616 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 FAM192AQ9GZU8 254 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 MEIS3P2A8K0S8 358 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 NDUFS3O75489 264 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 MAPK10P53779 464 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 PFKFB4Q16877 469 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 FAM187BQ17R55 369 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 IQSEC1Q6DN90 963 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 CDC26Q8NHZ8 85 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 VAT1Q99536 393 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 SEPHS2Q99611 448 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 C16orf70Q9BSU1 422 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 HAUS8Q9BT25 410 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 VRTNQ9H8Y1 702 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 RGS18Q9NS28 235 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 AP4S1Q9Y587 144 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 CCNFP41002 786 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 CPT1AP50416 773 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 WNT3AP56704 352 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 TAC4Q86UU9 113 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 HDAC10Q969S8 669 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 CCDC138Q96M89 665 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 VTI1BQ9UEU0 232 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 CROTQ9UKG9 612 aa14.58□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 PGK1P00558 417 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 AHSGP02765 367 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 HDCP19113 662 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 LRPAP1P30533 357 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 TAZQ16635 292 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 CIB1Q99828 191 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 GBA3Q9H227 469 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 HMX2A2RU54 273 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 A6NHS1 94 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 BTBD19C9JJ37 291 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 GSTA4O15217 222 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 PAGE1O75459 146 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 SGO1Q5FBB7 561 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 PKN3Q6P5Z2 889 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 ZNF534Q76KX8 674 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 TEKT5Q96M29 485 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 BTRCQ9Y297 605 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 UBR3Q6ZT12 1888 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 INPP4BO15327 924 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 OR6B1O95007 311 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 CHRM3P20309 590 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 CRABP2P29373 138 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 TBCELQ5QJ74 424 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 CNSTQ6PJW8 725 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 ACVR1CQ8NER5 493 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 ACTRT2Q8TDY3 377 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 SDCCAG3Q96C92 435 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 SLC39A3Q9BRY0 314 aa14.57□□□□□ -0.08
LLGL1-201ENST00000316843 SNNO75324 88 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms