RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283351.8

TRAPPC8-201, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC8, Length 6,226 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-201ENST00000283351 CYP4F2P78329 520 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 KLC1Q07866 573 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 EEF1DP3Q658K8 133 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 TTI2Q6NXR4 508 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 C11orf88Q6PI97 169 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 C12orf29Q8N999 325 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 KREMEN2Q8NCW0 462 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 OR52K1Q8NGK4 314 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 RUBCNQ92622 972 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 DTNBP1Q96EV8 351 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 GMIPQ9P107 970 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 LIMD1Q9UGP4 676 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 EPN2O95208 641 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 RTP1P59025 263 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 AGBL2Q5U5Z8 902 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 MON1AQ86VX9 555 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 KAZALD1Q96I82 304 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 HSFY1Q96LI6 401 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 COPS8Q99627 209 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 PCDH9Q9HC56 1237 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ATAD3AQ9NVI7 634 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ERVW-1Q9UQF0 538 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 DCCP43146 1447 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ATG7O95352 703 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 PTPRNQ16849 979 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 FAM45BPQ6NSW5 357 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 TMEM26Q6ZUK4 368 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 RAD21L1Q9H4I0 556 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 NEK6Q9HC98 313 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 IL5RAQ01344 420 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 CCINQ13939 588 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 AFTPHQ6ULP2 937 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ANKRD52Q8NB46 1076 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 LEMD2Q8NC56 503 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 C5orf34Q96MH7 638 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZIM3Q96PE6 472 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 A0A1B0GW55 424 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 FFAR2O15552 330 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 C1RP00736 705 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 DUX4L2P0CJ85 424 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 DUX4L3P0CJ86 424 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 DUX4L4P0CJ87 422 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 DUX4L5P0CJ88 424 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 DUX4L6P0CJ89 424 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 DUX4L7P0CJ90 424 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 TALDO1P37837 337 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 SLC25A24Q6NUK1 477 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 HDDC2Q7Z4H3 204 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 STARD8Q92502 1023 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 DUX4Q9UBX2 424 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ANXA6P08133 673 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 NR2F1P10589 423 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 PAX3P23760 479 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 CCDC185Q8N715 623 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 KLHL5Q96PQ7 755 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 CPNE1Q99829 537 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 WHRNQ9P202 907 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ERVK-11Q9UQG0 969 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 NDUFAF1Q9Y375 327 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 PIPSLA2A3N6 862 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 TTPAP49638 278 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 LPIN1Q14693 890 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 CNGA2Q16280 664 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 TTC23Q5W5X9 447 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 CCT8L2Q96SF2 557 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 GPR25O00155 361 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 TM4SF1P30408 202 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 RPL21P46778 160 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 SMYD1Q8NB12 490 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 MYO19Q96H55 970 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 SHDQ96IW2 340 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 MATN4O95460 622 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 GRM5P41594 1212 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 COLEC12Q5KU26 742 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 ARMC4Q5T2S8 1044 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 TNKS2Q9H2K2 1166 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 GDI1P31150 447 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 CRADDP78560 199 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 NPNTQ6UXI9 565 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 SERHL2Q9H4I8 314 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 SERHLQ9NQF3 203 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms