RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 MIPP30301 263 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SCNN1AP37088 669 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ACADSBP45954 432 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CDH6P55285 790 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 OSTNP61366 133 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP4F8P98187 520 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP11AP98196 1134 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 INCA1Q0VD86 236 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 LMAN2Q12907 356 aa7.2□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 SEMA3BQ13214 749 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 DMC1Q14565 340 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC14Q15048 493 aa7.2□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 UPP1Q16831 310 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.264e-10■■□□□ 12.4
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SMARCE1-201ENST00000264640 GPR158Q5T848 1215 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ANO7Q6IWH7 933 aa7.2□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 WDTC1Q8N5D0 677 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf127Q8N9H9 656 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 LEMD2Q8NC56 503 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 BPIFB1Q8TDL5 484 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 RLN3Q8WXF3 142 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TFAP2BQ92481 460 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHL29Q96CT2 875 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC39Q96DD0 335 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM84AQ96KN4 292 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM121Q9BTD3 319 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CALN1Q9BXU9 219 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC3Q9BY71 257 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 KLC2Q9H0B6 622 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ACSS3Q9H6R3 686 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 HPS4Q9NQG7 708 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM74BQ9NUR3 256 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHL11Q9NVR0 708 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 DPP3Q9NY33 737 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 AGAP1Q9UPQ3 857 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ANTXRLA6NF34 631 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 H0Y626 953 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa7.19□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 APOL1O14791 398 aa7.19□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 UBOX5O94941 541 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM16O95361 564 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 VNN2O95498 520 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ASMTLO95671 621 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 NEFHP12036 1026 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ARSAP15289 507 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TAC1P20366 129 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SDC4P31431 198 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL22P35268 128 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PNPLA4P41247 253 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PTGER3P43115 390 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 GPD2P43304 727 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC8A3P57103 927 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 DYNLT1P63172 113 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 BASP1P80723 227 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 OGDHQ02218 1023 aa7.19□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 DPYSL3Q14195 570 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 NOMO1Q15155 1222 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC142Q17RM4 750 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF423Q2M1K9 1284 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 BBS9Q3SYG4 887 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 GALNTL6Q49A17 601 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TPGS2Q68CL5 300 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 GAREM2Q75VX8 874 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SYT13Q7L8C5 426 aa7.19□□□□□ -1.26
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SMARCE1-201ENST00000264640 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 HDDC3Q8N4P3 179 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TTC9BQ8N6N2 239 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC52Q8N7C0 313 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FRMD1Q8N878 549 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 NAT8LQ8N9F0 302 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TSTD1Q8NFU3 115 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.19□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 JOSD2Q8TAC2 188 aa7.19□□□□□ -1.26
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