RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 TMEM62Q0P6H9 643 aa15.11■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 CDH17Q12864 832 aa15.11■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa15.11■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa15.11■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 TSPAN14Q8NG11 270 aa15.11■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 HMGCLL1Q8TB92 370 aa15.11■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 LRTOMTQ8WZ04 291 aa15.11■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 RNF181Q9P0P0 153 aa15.11■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 SHROOM3Q8TF72 1996 aa15.11■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 H0YJX3 145 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 NRP1O14786 923 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 NPHS1O60500 1241 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 TRMUO75648 421 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 CSPG5O95196 566 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 ARSAP15289 507 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 NPR3P17342 541 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 MPP1Q00013 466 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 IKBKEQ14164 716 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 DGKDQ16760 1214 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 PAQR9Q6ZVX9 377 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 DENND6AQ8IWF6 608 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 NUP93Q8N1F7 819 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 CEP70Q8NHQ1 597 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 GAB3Q8WWW8 586 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 NTAN1Q96AB6 310 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 TEKT5Q96M29 485 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 SLC9A7Q96T83 725 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 LRRC4Q9HBW1 653 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 TRPC5OSA6NMA1 111 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 MTSS1O43312 755 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 RAB10P61026 200 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 RHDQ02161 417 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 GALNT2Q10471 571 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 SCAPQ12770 1279 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 CTBP1Q13363 440 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 GRIK4Q16099 956 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 CNSTQ6PJW8 725 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 ARMCX2Q7L311 632 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 LIMS2Q7Z4I7 341 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 CARM1Q86X55 608 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 IRGQQ8WZA9 623 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 SLCO4A1Q96BD0 722 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 TNIP3Q96KP6 325 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 OSBPL2Q9H1P3 480 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 THEGQ9P2T0 379 aa15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 A0A0J9YVX5 310 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 ARHGEF37A1IGU5 675 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 TRIM24O15164 1050 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 JCHAINP01591 159 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 ZNF23P17027 643 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 FGFR3P22607 806 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 DNAJB1P25685 340 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 HCAR3P49019 387 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 RABGGTBP53611 331 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 EMP3P54852 163 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 LRP8Q14114 963 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 TAPT1Q6NXT6 567 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 CHSY3Q70JA7 882 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 CATSPER4Q7RTX7 472 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 PPTC7Q8NI37 304 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 KCTD13Q8WZ19 329 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 DPF3Q92784 378 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 TMIGD2Q96BF3 282 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 SGF29Q96ES7 293 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 CCT7Q99832 543 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 BRD8Q9H0E9 1235 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 UNC93B1Q9H1C4 597 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 KLK14Q9P0G3 267 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 CIDEBQ9UHD4 219 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 SNX10Q9Y5X0 201 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 H3BRB1 525 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 FBP2O00757 339 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 H6PDO95479 791 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 CD4P01730 458 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 TKTL1P51854 596 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 AIF1P55008 147 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 RALGDSQ12967 914 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 CLEC20AQ6ZU45 233 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 OTOP3Q7RTS5 596 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 CNTN4Q8IWV2 1026 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 SPPL2BQ8TCT7 592 aa15.09■□□□□ 0.01
SYP-201ENST00000263233 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74 ms