RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000240159.8

RNF170-201, Transcript of ring finger protein 170, humanhuman

TSL 2

Gene RNF170, Length 2,023 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF170-201ENST00000240159 MOSPD3O75425 235 aa22.97■■□□□ 1.27
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RNF170-201ENST00000240159 WDR4P57081 412 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 SHHQ15465 462 aa22.97■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 PACS1Q6VY07 963 aa22.97■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 BBS5Q8N3I7 341 aa22.97■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 SLC25A41Q8N5S1 370 aa22.97■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 MTBPQ96DY7 904 aa22.97■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 MGME1Q9BQP7 344 aa22.97■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa22.97■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 PSAT1Q9Y617 370 aa22.97■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 NDUFAB1O14561 156 aa22.96■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 FAM107AO95990 144 aa22.96■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 RHOP08100 348 aa22.96■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 SLC18A2Q05940 514 aa22.96■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 TEAD2Q15562 447 aa22.96■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 TAX1BP1Q86VP1 789 aa22.96■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 CPXM2Q8N436 756 aa22.96■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 GDAP1Q8TB36 358 aa22.96■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 PSKH2Q96QS6 385 aa22.96■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.96■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 GBF1Q92538 1859 aa22.96■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 PER2O15055 1255 aa22.96■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
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RNF170-201ENST00000240159 CNTFP26441 200 aa22.96■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 GPM6BQ13491 265 aa22.96■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 MROH9Q5TGP6 573 aa22.96■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
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RNF170-201ENST00000240159 CKAP2Q8WWK9 683 aa22.96■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 CHMP6Q96FZ7 201 aa22.96■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 SAMD11Q96NU1 681 aa22.96■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.96■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 TCAF1Q9Y4C2 921 aa22.96■■□□□ 1.27
RNF170-201ENST00000240159 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.95■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 CCDC78A2IDD5 438 aa22.95■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 ASMTLO95671 621 aa22.95■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 ERVK-21P61565 698 aa22.95■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 ARF5P84085 180 aa22.95■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 ZSCAN26Q16670 478 aa22.95■■□□□ 1.26
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RNF170-201ENST00000240159 WFDC5Q8TCV5 224 aa22.95■■□□□ 1.26
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RNF170-201ENST00000240159 FAM107BQ9H098 131 aa22.95■■□□□ 1.26
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RNF170-201ENST00000240159 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa22.94■■□□□ 1.26
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RNF170-201ENST00000240159 DDI1Q8WTU0 396 aa22.94■■□□□ 1.26
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RNF170-201ENST00000240159 OR51B4Q9Y5P0 310 aa22.94■■□□□ 1.26
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RNF170-201ENST00000240159 MYO7AQ13402 2215 aa22.94■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 XYLBO75191 536 aa22.94■■□□□ 1.26
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RNF170-201ENST00000240159 ADRA1DP25100 572 aa22.94■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 AVPR1AP37288 418 aa22.94■■□□□ 1.26
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RNF170-201ENST00000240159 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa22.94■■□□□ 1.26
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RNF170-201ENST00000240159 TASP1Q9H6P5 420 aa22.94■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 HELZP42694 1942 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 SNAP91O60641 907 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 ZMPSTE24O75844 475 aa22.93■■□□□ 1.26
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RNF170-201ENST00000240159 GP5P40197 560 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 CSKP41240 450 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 RGRP47804 291 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 IL9RQ01113 521 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 SIRPB2Q5JXA9 342 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 MFN1Q8IWA4 741 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 LEMD2Q8NC56 503 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 TCP10LQ8TDR4 215 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF170-201ENST00000240159 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
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