RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 SEMA3CQ99985 751 aa24.25■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 TRIM55Q9BYV6 548 aa24.25■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 IL23AQ9NPF7 189 aa24.25■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 SMPD4Q9NXE4 827 aa24.25■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa24.25■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 CAPN7Q9Y6W3 813 aa24.25■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 RHOCP08134 193 aa24.24■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 OVGP1Q12889 678 aa24.24■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 SETDB1Q15047 1291 aa24.24■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 CMC1Q7Z7K0 106 aa24.24■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 GPR65Q8IYL9 337 aa24.24■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 OR7D4Q8NG98 312 aa24.24■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 ISL2Q96A47 359 aa24.24■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 ATP13A1Q9HD20 1204 aa24.24■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 PCDH10Q9P2E7 1040 aa24.24■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 CHD5Q8TDI0 1954 aa24.24■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 A0A1B0GVM2 712 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 TCAF2A6NFQ2 919 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 MPOP05164 745 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 BPGMP07738 259 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 F7P08709 466 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 SPATA31D3P0C874 917 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 HADHAP40939 763 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 OXCT1P55809 520 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 CHI3L2Q15782 390 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 CNGA3Q16281 694 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 PPM1JQ5JR12 505 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 C16orf46Q6P387 395 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 CHST9Q7L1S5 443 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 ARRDC2Q8TBH0 407 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 IFT43Q96FT9 208 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 PDFQ9HBH1 243 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 SIRPGQ9P1W8 387 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 HGSO14964 777 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 TSPAN3O60637 253 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 GSTA1P08263 222 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 ABCG1P45844 678 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 FIBCD1Q8N539 461 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 PTPRSQ13332 1948 aa24.23■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 DCTN3O75935 186 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 UBOX5O94941 541 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 MAGEA12P43365 314 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF398Q8TD17 642 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 C10orf82Q8WW14 230 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 ZBED2Q9BTP6 218 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 RHOJQ9H4E5 214 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 TREX1Q9NSU2 369 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 ILVBLA1L0T0 632 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 H3BNC9 293 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 IL1BP01584 269 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 DBN1Q16643 649 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 CNTN4Q8IWV2 1026 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 FITM2Q8N6M3 262 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 RANBP9Q96S59 729 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM167BQ9BTA0 163 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 ZBP1Q9H171 429 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 CAB39LQ9H9S4 337 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 SEPT3Q9UH03 358 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC39A10Q9ULF5 831 aa24.22■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 A0A096LPK6 155 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 PLIN3O60664 434 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 CTSAP10619 480 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 SGSHP51688 502 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 BST1Q10588 318 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 SIRPB2Q5JXA9 342 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC91Q7Z6B0 441 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM150AQ86TG1 271 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 OR52K2Q8NGK3 314 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 TADA1Q96BN2 335 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 LRRC37BQ96QE4 947 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 CYP2S1Q96SQ9 504 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 DCTN4Q9UJW0 460 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 EMCNQ9ULC0 261 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC12A4Q9UP95 1085 aa24.21■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 E2F8A0AVK6 867 aa24.2■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 KDELR3O43731 214 aa24.2■■□□□ 1.47
RPUSD1-201ENST00000007264 TGDSO95455 350 aa24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms