RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020501.14

Sumo3-201, Transcript of Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sumo3, Length 2,630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Zscan5bB2RTN3 468 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Gm10250G3X9L6 160 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Zbtb11G5E8B9 1050 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 BC024978J3QPC3 361 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Bmpr2O35607 1038 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Serpini1O35684 410 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Slc2a4P14142 509 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cyth2P63034 400 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 AxlQ00993 888 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cyp2c65Q148B1 490 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ceacam5Q3UKK2 947 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Q8BGA7 448 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Slc38a9Q8BGD6 560 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Clec4gQ8BNX1 294 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Rbbp5Q8BX09 538 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Rfx6Q8C7R7 927 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Crlf2Q8CII9 359 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Nme5Q99MH5 211 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Txndc12Q9CQU0 170 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Dtwd1Q9D8U7 304 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Tmco5aQ9D9D5 303 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 EtfbQ9DCW4 255 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Atp5hQ9DCX2 161 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Chrac1Q9JKP8 129 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Adam17Q9Z0F8 827 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Lilra5D3Z7A9 295 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 C130060K24RikG3UWA8 416 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Vmn1r39G3UWE6 305 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cer1O55233 272 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cd160O88875 185 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Gsta4P24472 222 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Grm5Q3UVX5 1203 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Pla2g4dQ50L43 825 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Kpna1Q60960 538 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Gpr19Q61121 415 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Hdac7Q8C2B3 938 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Robo4Q8C310 1012 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Nlrp4bQ8C6J9 863 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Mgat5Q8R4G6 740 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Taf12Q8VE65 161 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Rpl34Q9D1R9 117 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Krt20Q9D312 431 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 PrelpQ9JK53 378 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ccr10Q9JL21 362 aa14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 QkiQ9QYS9 341 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Kat6aQ8BZ21 2003 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Kpna7C0LLJ0 499 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Il2P04351 169 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cd247P24161 164 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Gpr3P35413 330 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 TubP50586 505 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Mcm9Q2KHI9 1134 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Als2clQ60I26 952 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Dpy19l3Q71B07 716 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Gbp9Q8BTS3 619 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 AjubaQ91XC0 547 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Tfap2dQ91ZK0 452 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Tceal1Q921P9 165 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 AenQ9CZI9 336 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 4933428M09RikQ9D3X3 192 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Nmnat1Q9EPA7 285 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Vmn2r27D3YUK6 857 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Vmn2r115E9Q0E7 857 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Prf1P10820 554 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Gas2P11862 314 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 SykP48025 629 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Lhx3P50481 400 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Grxcr1Q50H32 290 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Nfe2l2Q60795 597 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Grid2Q61625 1007 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Fnip2Q80TD3 1108 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Tmem74Q8BQU7 305 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Pcdha1Q91Y21 948 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 TfQ921I1 697 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Tspan17Q9D7W4 270 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Prl5a1Q9JII2 230 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ror1Q9Z139 937 aa14.94□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 MgamB5THE2 1827 aa14.93□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Umodl1Q5DID3 1319 aa14.93□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Htr2cP34968 459 aa14.93□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Psma2P49722 234 aa14.93□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Rab6bP61294 208 aa14.93□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Hif1aQ61221 836 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Sp140Q6NSQ5 534 aa14.93□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Trnau1apQ80VC6 287 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ppp1r12bQ8BG95 976 aa14.93□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Stx16Q8BVI5 326 aa14.93□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Itpk1Q8BYN3 419 aa14.93□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Lrrc19Q8BZT5 364 aa14.93□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cacnb2Q8CC27 655 aa14.93□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ppp6r2Q8R3Q2 923 aa14.93□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cog2Q921L5 731 aa14.93□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Pdk3Q922H2 415 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Dclre1aQ9JIC3 1026 aa14.93□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Scube2Q9JJS0 997 aa14.93□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Abt1Q9QYL7 269 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Rfc2Q9WUK4 349 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 KcpQ3U492 1550 aa14.93□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Rpl9-ps6A0A140T8T4 192 aa14.93□□□□□ -0.02
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cdh18E9Q9Q6 790 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.1 ms