RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638939.1

PDE4D-229, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-229ENST00000638939 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 FGF11Q92914 225 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 KAT5Q92993 513 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 ALG14Q96F25 216 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 WBP1Q96G27 269 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 HIC2Q96JB3 615 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 KREMEN1Q96MU8 473 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 SLC2A13Q96QE2 648 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 MED15Q96RN5 788 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 MIS12Q9H081 205 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 C12orf49Q9H741 205 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 FAM204AQ9H8W3 233 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 USP29Q9HBJ7 922 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 ST7Q9NRC1 585 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 GPR27Q9NS67 375 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 ASNSD1Q9NWL6 643 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 PPM1HQ9ULR3 514 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 ZDHHC9Q9Y397 364 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 OR51B4Q9Y5P0 310 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 LRRK2Q5S007 2527 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 A6NNZ2 444 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 TRIM38O00635 465 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 MCF2LO15068 1137 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 SIAH2O43255 324 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 HSF2BPO75031 334 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 SDC3O75056 442 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 CLDN11O75508 207 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 PIAS2O75928 621 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 SMC2O95347 1197 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 GIMD1P0DJR0 217 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 ALPPL2P10696 532 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 CKMT1AP12532 417 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 PDGFRAP16234 1089 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 DGKAP23743 735 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 CCR1P32246 355 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 ARSDP51689 593 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 METAP1P53582 386 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 TMPRSS3P57727 454 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 TAS2R38P59533 333 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 ERVPABLB-1P60509 514 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 NUCB2P80303 420 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 RHDQ02161 417 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 CCDC15Q0P6D6 951 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 KCNMA1Q12791 1236 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 CNTN1Q12860 1018 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 BNIP3Q12983 259 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 STAT4Q14765 748 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 ZNF284Q2VY69 593 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 C5orf22Q49AR2 442 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 CCDC40Q4G0X9 1142 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 HS1BP3Q53T59 392 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 CDCP2Q5VXM1 449 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 TTI2Q6NXR4 508 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 FBXL22Q6P050 247 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 PCSK4Q6UW60 755 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 GCNT7Q6ZNI0 430 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 Q6ZVU0 165 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 ZNF438Q7Z4V0 828 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 ZSCAN30Q86W11 494 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 ATCAYQ86WG3 371 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 TRIM59Q8IWR1 403 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 LSMEM2Q8N112 164 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 SLC25A45Q8N413 288 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 FAM181AQ8N9Y4 354 aa5.63□□□□□ -1.51
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PDE4D-229ENST00000638939 SMARCE1Q969G3 411 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 KLHDC7BQ96G42 594 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 FAM81BQ96LP2 452 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 CCDC114Q96M63 670 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 TIGD1Q96MW7 591 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 DEPDC7Q96QD5 511 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 LGMNQ99538 433 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 FEM1AQ9BSK4 669 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 KLHL11Q9NVR0 708 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 DDIT4Q9NX09 232 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 NLGN3Q9NZ94 848 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 SARDHQ9UL12 918 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 HRH3Q9Y5N1 445 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 RAI2Q9Y5P3 530 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-229ENST00000638939 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
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