RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638372.1

SCARB2-208, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

TSL 5

Gene SCARB2, Length 4,811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-208ENST00000638372 GDPD5Q8WTR4 605 aa14.52□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 SLC25A23Q9BV35 468 aa14.52□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 HMGXB4Q9UGU5 601 aa14.52□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 DYRK1BQ9Y463 629 aa14.52□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 TMEM114B3SHH9 223 aa14.52□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 CLPTM1O96005 669 aa14.52□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 POU1F1P28069 291 aa14.52□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 TEX44Q53QW1 395 aa14.52□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 PPM1LQ5SGD2 360 aa14.52□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 OR6Y1Q8NGX8 325 aa14.52□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.52□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 ACMSDQ8TDX5 336 aa14.52□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 ZNF558Q96NG5 402 aa14.52□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 MINDY3Q9H8M7 445 aa14.52□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa14.52□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 PLK2Q9NYY3 685 aa14.52□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 ZNF229Q9UJW7 825 aa14.52□□□□□ -0.08
SCARB2-208ENST00000638372 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 SERPINA4P29622 427 aa14.52□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 PTGIRP43119 386 aa14.52□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 RAB10P61026 200 aa14.52□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 MTA1Q13330 715 aa14.52□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.52□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.52□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa14.52□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 SIKE1Q9BRV8 207 aa14.52□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 GIMAP4Q9NUV9 329 aa14.52□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa14.52□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.52□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 SPRYD7Q5W111 196 aa14.52□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 SLC44A1Q8WWI5 657 aa14.52□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa14.52□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 CHRAC1Q9NRG0 131 aa14.52□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 SLIT2O94813 1529 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 A0A1W2PQH9 124 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 HDAC3O15379 428 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 AMHP03971 560 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 FASP25445 335 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 PSEN1P49768 467 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 CDK18Q07002 472 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 NOGQ13253 232 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 MFSD5Q6N075 450 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 OR6K2Q8NGY2 324 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 RSPH1Q8WYR4 309 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 TMEM79Q9BSE2 394 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 WDR41Q9HAD4 459 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 CACNG4Q9UBN1 327 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 KLQ9UEF7 1012 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 A0A087X1B8 175 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 C2CD4BA6NLJ0 364 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 CSH1P0DML2 217 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 CSH2P0DML3 217 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 ARL4DP49703 201 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 NRLP54845 237 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 FAM9CQ8IZT9 166 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 PCED1BQ96HM7 432 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 RNF145Q96MT1 663 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 SH3GL1Q99961 368 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 FTHL17Q9BXU8 183 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 ARHGEF4Q9NR80 690 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 OPTCQ9UBM4 332 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 CCDC154A6NI56 674 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 SERPINB10P48595 397 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 ALDH9A1P49189 494 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 CACNA2D1P54289 1103 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 ACOX1Q15067 660 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 CRY1Q16526 586 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 TJAP1Q5JTD0 557 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 ARCQ7LC44 396 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 RIN3Q8TB24 985 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 SERAC1Q96JX3 654 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 CORO1BQ9BR76 489 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 GLOD4Q9HC38 313 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 PNPOQ9NVS9 261 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 PRDM4Q9UKN5 801 aa14.51□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.5□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 ADCY6O43306 1168 aa14.5□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 TBL1XO60907 577 aa14.5□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 OR56A5P0C7T3 313 aa14.5□□□□□ -0.09
SCARB2-208ENST00000638372 LRPAP1P30533 357 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.4 ms