RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 MID1O15344 667 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 DFNA5O60443 496 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 FYNP06241 537 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 LCP1P13796 627 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS24P62847 133 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJC3Q13217 504 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ARCQ7LC44 396 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 AZIN2Q96A70 460 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLPH3Q9H4A6 298 aa24.72■■□□□ 1.55
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CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PP55 124 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM47DPA6NHR8 397 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF185O15231 689 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 IRAK2O43187 625 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT3P12035 628 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 RGS7P49802 495 aa24.71■■□□□ 1.55
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CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC181Q5TID7 509 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC38Q5VT99 294 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 MFN1Q8IWA4 741 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAM32Q8TC27 787 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 TSC1Q92574 1164 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM129BQ96TA1 746 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 SYNCQ9H7C4 482 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 STIM2Q9P246 746 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
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CAPNS1-216ENST00000628306 PIK3R2O00459 728 aa24.7■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 TUBBP07437 444 aa24.7■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ITPKBP27987 946 aa24.7■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ACADVLP49748 655 aa24.7■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 C21orf59P57076 290 aa24.7■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 NUGGCQ68CJ6 796 aa24.7■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 DCUN1D2Q6PH85 259 aa24.7■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 AADATQ8N5Z0 425 aa24.7■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 KDM1BQ8NB78 822 aa24.7■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 IRGQQ8WZA9 623 aa24.7■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC34A8MYJ7 566 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 SPOPO43791 374 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 C1QL1O75973 258 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 ERBB2P04626 1255 aa24.69■■□□□ 1.54
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CAPNS1-216ENST00000628306 SLC11A2P49281 568 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 INAVAQ3KP66 663 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 C2CD6Q53TS8 623 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa24.69■■□□□ 1.54
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CAPNS1-216ENST00000628306 MMGT1Q8N4V1 131 aa24.69■■□□□ 1.54
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CAPNS1-216ENST00000628306 OR2T34Q8NGX1 318 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC39A13Q96H72 371 aa24.69■■□□□ 1.54
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CAPNS1-216ENST00000628306 LTFP02788 710 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 ASLP04424 464 aa24.68■■□□□ 1.54
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CAPNS1-216ENST00000628306 TBX4P57082 545 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 PITRM1Q5JRX3 1037 aa24.68■■□□□ 1.54
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CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM59LQ9UK28 342 aa24.68■■□□□ 1.54
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CAPNS1-216ENST00000628306 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
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CAPNS1-216ENST00000628306 MS4A13Q5J8X5 152 aa24.67■■□□□ 1.54
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CAPNS1-216ENST00000628306 LRRN4CLQ8ND94 238 aa24.67■■□□□ 1.54
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CAPNS1-216ENST00000628306 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 GANCQ8TET4 914 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM131CQ96AQ9 280 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 BTBD6Q96KE9 485 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 CAPZA3Q96KX2 299 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 NCAPGQ9BPX3 1015 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
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