RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	CARD16	Q5EG05	197 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	NEK5	Q6P3R8	708 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	NT5C3B	Q969T7	300 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ABCG4	Q9H172	646 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	DNAI1	Q9UI46	699 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	KLF15	Q9UIH9	416 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078		K7ESM1	405 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	USP12	O75317	370 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	CS	O75390	466 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ZMPSTE24	O75844	475 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	C1QL1	O75973	258 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	CKMT1A	P12532	417 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ADRB3	P13945	408 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ITIH2	P19823	946 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	L1CAM	P32004	1257 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ACTN2	P35609	894 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	NEK3	P51956	506 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	GNA12	Q03113	381 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	MTA1	Q13330	715 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	C1orf61	Q13536	156 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	FZD2	Q14332	565 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	TCEA2	Q15560	299 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	MIIP	Q5JXC2	388 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	NAA35	Q5VZE5	725 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	RFFL	Q8WZ73	363 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	FEM1C	Q96JP0	617 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	C1orf74	Q96LT6	269 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	LGMN	Q99538	433 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	HDAC8	Q9BY41	377 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	RRN3	Q9NYV6	651 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ILVBL	A1L0T0	632 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078		A6NNZ2	444 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	KRIT1	O00522	736 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	NEMP1	O14524	444 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	CD160	O95971	181 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ALPPL2	P10696	532 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ABL2	P42684	1182 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	GABRB2	P47870	512 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	BPIFB4	P59827	614 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	GABRE	P78334	506 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	TLE3	Q04726	772 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	SGCG	Q13326	291 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	IFI44	Q8TCB0	444 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	MAPK15	Q8TD08	544 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	LMX1A	Q8TE12	382 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078		U3KQA8	63 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	FAM72C	H0Y354	149 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	SCAMP1	O15126	338 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	SPINT1	O43278	529 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	TGM2	P21980	687 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	KLK7	P49862	253 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	CLCN6	P51797	869 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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