RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
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CTDP1-208ENST00000613122 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
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CTDP1-208ENST00000613122 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
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CTDP1-208ENST00000613122 ETS1P14921 441 aa20.41■□□□□ 0.86
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CTDP1-208ENST00000613122 C12orf29Q8N999 325 aa20.4■□□□□ 0.86
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CTDP1-208ENST00000613122 C7orf61Q8IZ16 206 aa20.39■□□□□ 0.86
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CTDP1-208ENST00000613122 UGT2B28Q9BY64 529 aa20.39■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 NOD2Q9HC29 1040 aa20.39■□□□□ 0.86
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CTDP1-208ENST00000613122 MAPRE3Q9UPY8 281 aa20.39■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa20.39■□□□□ 0.86
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CTDP1-208ENST00000613122 INPP4BO15327 924 aa20.39■□□□□ 0.85
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CTDP1-208ENST00000613122 ELFN1P0C7U0 828 aa20.39■□□□□ 0.85
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CTDP1-208ENST00000613122 FAM180AQ6UWF9 173 aa20.39■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 MTERF3Q96E29 417 aa20.39■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 BDH2Q9BUT1 245 aa20.39■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.39■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa20.39■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa20.39■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 TBC1D3EA0A087X179 549 aa20.39■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa20.39■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 SAC3D1A6NKF1 404 aa20.39■□□□□ 0.85
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