RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612161.4

SLC38A1-211, Transcript of solute carrier family 38 member 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC38A1, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A1-211ENST00000612161 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 TCTE1Q5JU00 501 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 SHEQ5VZ18 495 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 ATL3Q6DD88 541 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 GPR142Q7Z601 462 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 PXKQ7Z7A4 578 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 ITIH5Q86UX2 942 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 ATAD1Q8NBU5 361 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 PPFIBP2Q8ND30 876 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 HCAR2Q8TDS4 363 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 SEPT1Q8WYJ6 367 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 SEC14L1Q92503 715 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 FEM1CQ96JP0 617 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 TSNARE1Q96NA8 513 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 SELENOSQ9BQE4 189 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 CCDC77Q9BR77 488 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 SOX7Q9BT81 388 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 TIPINQ9BVW5 301 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 MBD5Q9P267 1494 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 KCNN3Q9UGI6 736 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 RAB21Q9UL25 225 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 L3MBTL1Q9Y468 752 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.4□□□□□ -1.38
SLC38A1-211ENST00000612161 FAM135BQ49AJ0 1406 aa6.4□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 UBE2CO00762 179 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 BET1O15155 118 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 MT-ND3P03897 115 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 CLEC3BP05452 202 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 FYNP06241 537 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 KRT7P08729 469 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 PDHBP11177 359 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 IFNAR2P48551 515 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 PIK3CGP48736 1102 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 ADARP55265 1226 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 CSNK2BP67870 215 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 MC1RQ01726 317 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 NCF4Q15080 339 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 RGS21Q2M5E4 152 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 CYP27C1Q4G0S4 372 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 CEP55Q53EZ4 464 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 CLVS2Q5SYC1 327 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 SP8Q8IXZ3 490 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 CNBD1Q8NA66 436 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 LINS1Q8NG48 757 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 TTLQ8NG68 377 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 TEX47Q8TBZ9 253 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 DDI1Q8WTU0 396 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 RAPGEF5Q92565 580 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 GATA6Q92908 595 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 CEP170P1Q96L14 293 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 CLIC6Q96NY7 704 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 EYA3Q99504 573 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 TRIM15Q9C019 465 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 NYXQ9GZU5 481 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 C2orf40Q9H1Z8 148 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 HPS4Q9NQG7 708 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 MID2Q9UJV3 735 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 LRRC42Q9Y546 428 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 A0A087WWL8 130 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 CCDC69A6NI79 296 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 ACOD1A6NK06 481 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 STMND1H3BQB6 276 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 PCDH17O14917 1159 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 ATP9AO75110 1047 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 GPC4O75487 556 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 GJB3O75712 270 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 ALDH1A2O94788 518 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 F9P00740 461 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 GSTA1P08263 222 aa6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 NOP14P78316 857 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SLC38A1-211ENST00000612161 CHRNEQ04844 493 aa6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms