RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600393.1

FCHO1-233, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-233	ENST00000600393	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC25A45	Q8N413	288 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FCHO1-233	ENST00000600393	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FCHO1-233	ENST00000600393	TMIE	Q8NEW7	156 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FCHO1-233	ENST00000600393	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FCHO1-233	ENST00000600393	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FCHO1-233	ENST00000600393	CCDC114	Q96M63	670 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FCHO1-233	ENST00000600393	HAPLN3	Q96S86	360 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FCHO1-233	ENST00000600393	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FCHO1-233	ENST00000600393	DYRK4	Q9NR20	520 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FCHO1-233	ENST00000600393	FANCL	Q9NW38	375 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FCHO1-233	ENST00000600393	DNAI1	Q9UI46	699 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FCHO1-233	ENST00000600393	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
FCHO1-233	ENST00000600393	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
FCHO1-233	ENST00000600393	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	JUP	P14923	745 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	AKT2	P31751	481 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	ADRA1B	P35368	520 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	ABL2	P42684	1182 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	CLCN6	P51797	869 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	SYCP1	Q15431	976 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	PROX2	Q3B8N5	592 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	IQCH	Q86VS3	1027 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	NLRP14	Q86W24	1093 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	OXR1	Q8N573	874 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	HDAC8	Q9BY41	377 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	KALRN	O60229	2985 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	POM121B	A6NF01	834 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	SPINT1	O43278	529 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	LRIG2	O94898	1065 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	ADRB3	P13945	408 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	DGKA	P23743	735 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	ITGB7	P26010	798 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	SDC4	P31431	198 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	HNF1B	P35680	557 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	NUDT1	P36639	197 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	NEK3	P51956	506 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	HDAC4	P56524	1084 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	SEMG2	Q02383	582 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	OVGP1	Q12889	678 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF677	Q86XU0	584 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	VOPP1	Q96AW1	172 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	KLC2	Q9H0B6	622 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	DKK4	Q9UBT3	224 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	MGA	Q8IWI9	3026 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	MAGEC1	O60732	1142 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	NEBL	O76041	1014 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	UGT2B4	P06133	528 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	CKMT2	P17540	419 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	L1CAM	P32004	1257 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	PTPN9	P43378	593 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	CARD16	Q5EG05	197 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393		Q6ZSR6	202 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	ARC	Q7LC44	396 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	TMC6	Q7Z403	805 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	BMF	Q96LC9	184 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	CEP44	Q9C0F1	390 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FCHO1-233	ENST00000600393	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31

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