RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591417.5

HKR1-222, Transcript of HKR1, GLI-Kruppel zinc finger family member, human

TSL 4 BASIC

Gene HKR1, Length 525 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HKR1-222	ENST00000591417		U3KQA8	63 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	ATM	Q13315	3056 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	POM121B	A6NF01	834 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417		K7ERQ8	282 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417		M0QYT0	321 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	NEMP1	O14524	444 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	AP1G1	O43747	822 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	SNAP91	O60641	907 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	LEFTY1	O75610	366 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	GRAP2	O75791	330 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	TNFSF15	O95150	251 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	GJB6	O95452	261 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	ADCY5	O95622	1261 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	F9	P00740	461 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	ADRB3	P13945	408 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	ITGB7	P26010	798 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	OR1E1	P30953	314 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	L1CAM	P32004	1257 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	USP8	P40818	1118 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	DNA2	P51530	1060 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	SKOR1	P84550	965 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	GUSBP11	Q6P575	273 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	CHST14	Q8NCH0	376 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	SPATA20	Q8TB22	786 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	RAB7B	Q96AH8	199 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	PSMB7	Q99436	277 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	CEP44	Q9C0F1	390 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	MUSK	O15146	869 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	TSPAN6	O43657	245 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	CNTN5	O94779	1100 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	ENDOD1	O94919	500 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	ANXA6	P08133	673 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	KRT9	P35527	623 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	CSRP3	P50461	194 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	IRAK1	P51617	712 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	THOP1	P52888	689 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	INHBC	P55103	352 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	SLC6A3	Q01959	620 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	PTK2	Q05397	1052 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	SPIDR	Q14159	915 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	CARD16	Q5EG05	197 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	LINGO4	Q6UY18	593 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	C14orf80	Q86SX3	495 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	ASB12	Q8WXK4	309 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	C1orf74	Q96LT6	269 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	TIGD1	Q96MW7	591 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	CPXM1	Q96SM3	734 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	SPON2	Q9BUD6	331 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	GPR27	Q9NS67	375 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	RP1	P56715	2156 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	ILVBL	A1L0T0	632 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	DRGX	A6NNA5	263 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	TOR1B	O14657	336 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	DAB1	O75553	588 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	ITGA2B	P08514	1039 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	SFTPC	P11686	197 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	GGCX	P38435	758 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	CXCR3	P49682	368 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	ALF	Q53S48	1182 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	ISM2	Q6H9L7	571 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HKR1-222	ENST00000591417	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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