RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 NUP85Q9BW27 656 aa11.91□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 ABCG4Q9H172 646 aa11.91□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 FBXO44Q9H4M3 255 aa11.91□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 CNGB3Q9NQW8 809 aa11.91□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 UVRAGQ9P2Y5 699 aa11.91□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 LCMT1Q9UIC8 334 aa11.91□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 FN1P02751 2386 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 BTNL10A8MVZ5 291 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 TULP2O00295 520 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 TSPAN3O60637 253 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 BEST1O76090 585 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 ERBB2P04626 1255 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 CYP1A2P05177 515 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 ITGA2BP08514 1039 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 KRT3P12035 628 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC5A3P53794 718 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 GSCP56915 257 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC6A3Q01959 620 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 GAD2Q05329 585 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 BNIP3Q12983 259 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 DDR2Q16832 855 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 C2CD6Q53TS8 623 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 EFHC1Q5JVL4 640 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 MANEAQ5SRI9 462 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 NUP93Q8N1F7 819 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 C3orf20Q8ND61 904 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM149B1Q96BN6 582 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 TRIM62Q9BVG3 475 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 CASS4Q9NQ75 786 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 GDF3Q9NR23 364 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 KCND1Q9NSA2 647 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 COMMD8Q9NX08 183 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 CYTH4Q9UIA0 394 aa11.9□□□□□ -0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 ESPL1Q14674 2120 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 ARHGAP10A1A4S6 786 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 C2orf78A6NCI8 922 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 ESPNB1AK53 854 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 MYO1FO00160 1098 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 BUB1O43683 1085 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 SIGLEC6O43699 453 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 ZBED1O96006 694 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 DRD2P14416 443 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 SCNN1AP37088 669 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 CACNA2D1P54289 1103 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 ZXDBP98169 803 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 KLRB1Q12918 225 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 LY6G5CQ5SRR4 150 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 XYLT1Q86Y38 959 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 TMPRSS6Q8IU80 811 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 REXO1L1PQ8IX06 675 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 MCEMP1Q8IX19 187 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 SYCE1Q8N0S2 351 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 ARHGAP18Q8N392 663 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 EFCAB3Q8N7B9 438 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 ZMIZ2Q8NF64 920 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC35G2Q8TBE7 412 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 SPATA17Q96L03 361 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 SLITRK1Q96PX8 696 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 ULBP1Q9BZM6 244 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 LACRTQ9GZZ8 138 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 SEPT10Q9P0V9 454 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 TFR2Q9UP52 801 aa11.89□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 PMS2P1A4D2B8 440 aa11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 RCCD1A6NED2 376 aa11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 SIGLEC16A6NMB1 481 aa11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 USP27XA6NNY8 438 aa11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 WASH3PC4AMC7 463 aa11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 HSF2BPO75031 334 aa11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 FSBPO95073 299 aa11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 TUBB4AP04350 444 aa11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 GLI1P08151 1106 aa11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 YWHAQP27348 245 aa11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 RPL34P49207 117 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 GPR15P49685 360 aa11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 PTP4A2Q12974 167 aa11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 MAMLD1Q13495 774 aa11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 TESK1Q15569 626 aa11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 RAB41Q5JT25 222 aa11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 SDHAF4Q5VUM1 108 aa11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 STKLD1Q8NE28 680 aa11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 TRIM58Q8NG06 486 aa11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 IRGQQ8WZA9 623 aa11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 FBXO32Q969P5 355 aa11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 ARHGEF26Q96DR7 871 aa11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 MCEEQ96PE7 176 aa11.88□□□□□ -0.51
CAPNS1-209ENST00000590049 OSBPL2Q9H1P3 480 aa11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms