RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF534Q76KX8 674 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 APCDD1Q8J025 514 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 SEMA4AQ9H3S1 761 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 EPS15L1Q9UBC2 864 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 GGA2Q9UJY4 613 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 SNAP91O60641 907 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC4O95801 387 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMC3P17980 439 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 ITKQ08881 620 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 NR1H3Q13133 447 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 PITRM1Q5JRX3 1037 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 SYCP2LQ5T4T6 812 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 YAF2Q8IY57 180 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 LRCH3Q96II8 777 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 PKNOX2Q96KN3 472 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-206ENST00000588815 TSHRP16473 764 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 RALGPS1Q5JS13 557 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBED8Q8IZ13 594 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 IQCKQ8N0W5 287 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 AHI1Q8N157 1196 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 PGBD5Q8N414 524 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 TADA1Q96BN2 335 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 ASIC4Q96FT7 647 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 F5H423 210 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 RIPK2O43353 540 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 CD160O95971 181 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 BBS9Q3SYG4 887 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC38Q502W7 563 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 ARRDC2Q8TBH0 407 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 PYROXD1Q8WU10 500 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM161BQ96MY7 647 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 SASH3O75995 380 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 NUDT17P0C025 328 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 CYTH1Q15438 398 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 DENND2CQ68D51 928 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM68Q6AZZ1 485 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 LEKR1Q6ZMV7 388 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 CPA6Q8N4T0 437 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATA22Q8NHS9 363 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 ECT2Q9H8V3 914 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 CASS4Q9NQ75 786 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 NINJ2Q9NZG7 142 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 TEX264Q9Y6I9 313 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 TMCC1O94876 653 aa31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 MAXP61244 160 aa31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 MSS51Q4VC12 460 aa31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 LRIG3Q6UXM1 1119 aa31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 SEMA3CQ99985 751 aa31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 EBF3Q9H4W6 596 aa31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPINF2P08697 491 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 ABHD2P08910 425 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 CR2P20023 1033 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 NIPAL4Q0D2K0 466 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 CDH17Q12864 832 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 ARMC3Q5W041 872 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 CCNJLQ8IV13 435 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 TBL1YQ9BQ87 522 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 NAT9Q9BTE0 207 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 FSD1LQ9BXM9 530 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 EPB41L4BQ9H329 900 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A13Q9UJS0 675 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 HS3ST2Q9Y278 367 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 COL4A3Q01955 1670 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 SPAG6O75602 509 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 MMP2P08253 660 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 ARSAP15289 507 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 NPY2RP49146 381 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 DGKGP49619 791 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 DSC2Q02487 901 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 KYNUQ16719 465 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 FUT11Q495W5 492 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 KDELC1Q6UW63 502 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP11CQ8NB49 1132 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 SIGLEC10Q96LC7 697 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 C9orf72Q96LT7 481 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 NUDCD1Q96RS6 583 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 RUFY1Q96T51 708 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 HPS4Q9NQG7 708 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 UBP1Q9NZI7 540 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 BFARQ9NZS9 450 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 SDR42E2A6NKP2 422 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-206ENST00000588815 MUSKO15146 869 aa31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms