RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586276.5

EFTUD2-205, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,678 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-205ENST00000586276 KRT17Q04695 432 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 SLC34A1Q06495 639 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.022e-6■■■□□ 17.5
EFTUD2-205ENST00000586276 MED21Q13503 144 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 NFYCQ13952 458 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 GRM3Q14832 879 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 DPYSL2Q16555 572 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 MINDY1Q8N5J2 469 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 STMN2Q93045 179 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 SARGQ9BW04 601 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 NPHS2Q9NP85 383 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 GGA1Q9UJY5 639 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 RCOR1Q9UKL0 485 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 PSAT1Q9Y617 370 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 MAU2Q9Y6X3 613 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 MED14O60244 1454 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 LOC100653049A0A140TA62 436 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 J3QW42 95 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 TRIM38O00635 465 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 SGCEO43556 437 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 KRT34O76011 436 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 OPN1MWP04001 364 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 SHBGP04278 402 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 TM4SF4P48230 202 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 LIG4P49917 911 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 NFKB2Q00653 900 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 DSG1Q02413 1049 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 SPARCL1Q14515 664 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 USP10Q14694 798 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 TAF5Q15542 800 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 Q5PR19 223 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 LIPNQ5VXI9 398 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 NANOGP8Q6NSW7 305 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 AACSQ86V21 672 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 PRR18Q8N4B5 295 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 ATP2A3Q93084 1043 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 DACH2Q96NX9 599 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 RASSF1Q9NS23 344 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 GDAP2Q9NXN4 497 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 DLC1Q96QB1 1528 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 CLUHO75153 1309 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 EVPLLA8MZ36 301 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 NDUFS8O00217 210 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 SCAMP1O15126 338 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 AHCYP23526 432 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 SERPINB1P30740 379 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 MEOX2P50222 304 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 GIT2Q14161 759 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 ARHGAP19Q14CB8 494 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 ERFEQ4G0M1 354 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 MPP7Q5T2T1 576 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 KIF18BQ86Y91 864 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 TTLL6Q8N841 843 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 TMEM80Q96HE8 168 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 BOLA2Q9H3K6 86 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 EVA1AQ9H8M9 152 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 GNPTGQ9UJJ9 305 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 ZNF229Q9UJW7 825 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 SNX24Q9Y343 169 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-205ENST00000586276 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
EFTUD2-205ENST00000586276 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa8.65□□□□□ -1.03
EFTUD2-205ENST00000586276 MEI4A8MW99 385 aa8.65□□□□□ -1.03
EFTUD2-205ENST00000586276 TAF5LO75529 589 aa8.65□□□□□ -1.03
EFTUD2-205ENST00000586276 ENDOD1O94919 500 aa8.65□□□□□ -1.03
EFTUD2-205ENST00000586276 SLITRK5O94991 958 aa8.65□□□□□ -1.03
EFTUD2-205ENST00000586276 PRAMEF12O95522 483 aa8.65□□□□□ -1.03
EFTUD2-205ENST00000586276 STSP08842 583 aa8.65□□□□□ -1.03
EFTUD2-205ENST00000586276 CDH1P12830 882 aa8.65□□□□□ -1.03
EFTUD2-205ENST00000586276 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
EFTUD2-205ENST00000586276 SLC12A3P55017 1021 aa8.65□□□□□ -1.03
EFTUD2-205ENST00000586276 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
EFTUD2-205ENST00000586276 ITKQ08881 620 aa8.65□□□□□ -1.03
EFTUD2-205ENST00000586276 KCNC3Q14003 757 aa8.65□□□□□ -1.03
EFTUD2-205ENST00000586276 PIK3R6Q5UE93 754 aa8.65□□□□□ -1.03
EFTUD2-205ENST00000586276 STRIP1Q5VSL9 837 aa8.65□□□□□ -1.03
EFTUD2-205ENST00000586276 FRA10AC1Q70Z53 315 aa8.65□□□□□ -1.03
EFTUD2-205ENST00000586276 SSX9Q7RTT3 188 aa8.65□□□□□ -1.03
EFTUD2-205ENST00000586276 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa8.65□□□□□ -1.03
EFTUD2-205ENST00000586276 MB21D1Q8N884 522 aa8.65□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms