RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC12A1Q13621 1099 aa16.73■□□□□ 0.27
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CHD5Q8TDI0 1954 aa16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TARM1B6A8C7 271 aa16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TK2O00142 265 aa16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC1A2P43004 574 aa16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WNT3AP56704 352 aa16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CTBP1Q13363 440 aa16.7■□□□□ 0.26
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CNGA3Q16281 694 aa16.7■□□□□ 0.26
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