RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	TAS2R38	P59533	333 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	DPYD	Q12882	1025 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	C1orf61	Q13536	156 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	5.09	□□□□□ -1.59	9e-8	■□□□□ 11.3
MSI2-216	ENST00000582772	ELOC	Q15369	112 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772		Q4G0T1	1027 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	SPATA1	Q5VX52	437 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	CASC1	Q6TDU7	716 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	NLRP8	Q86W28	1048 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	TICAM2	Q86XR7	235 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	C8orf48	Q96LL4	319 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	MYOC	Q99972	504 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	BCL11A	Q9H165	835 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	SENP2	Q9HC62	589 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	FZD3	Q9NPG1	666 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	MEMO1	Q9Y316	297 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MSI2-216	ENST00000582772	FAM92A	A1XBS5	289 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	POM121B	A6NF01	834 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	SMCO2	A6NFE2	343 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772		M0QYT0	321 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	SOCS6	O14544	535 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF185	O15231	689 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	LYPLA2	O95372	231 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ABL1	P00519	1130 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ADRB2	P07550	413 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	IRF1	P10914	325 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	MUT	P22033	750 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	PTPN4	P29074	926 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	SLC12A3	P55017	1021 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	RRAD	P55042	308 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	PFN3	P60673	137 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	COL10A1	Q03692	680 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	MYBPC3	Q14896	1274 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	INA	Q16352	499 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	FAM171B	Q6P995	826 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	HORMAD1	Q86X24	394 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	WDR49	Q8IV35	697 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	P3H2	Q8IVL5	708 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	CPXM2	Q8N436	756 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	PIP5K1A	Q99755	562 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	CTRC	Q99895	268 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	MTG2	Q9H4K7	406 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	APMAP	Q9HDC9	416 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	VAV3	Q9UKW4	847 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	GPR34	Q9UPC5	381 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772		A0A1W2PQU0	124 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	ZBTB39	O15060	712 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSI2-216	ENST00000582772	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6

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