RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	FPGT	O14772	594 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	TSPAN6	O43657	245 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	AP1G1	O43747	822 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	SDC3	O75056	442 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	ADRB3	P13945	408 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	FMO1	Q01740	532 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	MYL5	Q02045	173 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	DNAJC3	Q13217	504 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	CCDC14	Q49A88	953 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	EFHC2	Q5JST6	749 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	TSC1	Q92574	1164 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	FANCL	Q9NW38	375 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	DNAI1	Q9UI46	699 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	RAX	Q9Y2V3	346 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	KRIT1	O00522	736 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	ZMPSTE24	O75844	475 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	GSR	P00390	522 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	GPD1	P21695	349 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	GLDC	P23378	1020 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	DGKA	P23743	735 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	ACP1	P24666	158 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	RABIF	P47224	123 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	AIF1	P55008	147 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	JAM2	P57087	298 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	UBXN1	Q04323	297 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	STX1A	Q16623	288 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	HES3	Q5TGS1	186 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	C3orf20	Q8ND61	904 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	NTAN1	Q96AB6	310 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	USP29	Q9HBJ7	922 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-208	ENST00000579743	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		13.96	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	BUB1	O43683	1085 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	SIGLEC6	O43699	453 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	LRIG2	O94898	1065 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	ARF5	P84085	180 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	CAMK2B	Q13554	666 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	TRNP1	Q6NT89	227 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743		Q6ZSR6	202 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	OR13H1	Q8NG92	308 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	OR4C6	Q8NH72	309 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	GPT2	Q8TD30	523 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	BAP1	Q92560	729 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	EPAS1	Q99814	870 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	ABCG4	Q9H172	646 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	FZD3	Q9NPG1	666 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		13.95	□□□□□ -0.18

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