RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	CPXM1	Q96SM3	734 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	SIK2	Q9H0K1	926 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	ACP6	Q9NPH0	428 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	IL36A	Q9UHA7	158 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169		A0A0D9SEW6	157 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	ARHGAP6	O43182	974 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	AQP9	O43315	295 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	SLC28A2	O43868	658 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	LEFTY1	O75610	366 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	TCEA3	O75764	348 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	GRAP2	O75791	330 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	RHOC	P08134	193 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	GNA15	P30679	374 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	RABIF	P47224	123 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	NEK3	P51956	506 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	NME3	Q13232	169 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	CLN3	Q13286	438 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	PERM1	Q5SV97	790 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	TTI2	Q6NXR4	508 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	SMARCE1	Q969G3	411 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	FEM1C	Q96JP0	617 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	DRGX	A6NNA5	263 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	BECN2	A8MW95	431 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169		I6L893	689 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169		M0QYT0	321 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	SPINT1	O43278	529 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	AP1G1	O43747	822 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	ADRB3	P13945	408 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	JUND	P17535	347 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	ITGB7	P26010	798 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	L1CAM	P32004	1257 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	NOS2	P35228	1153 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	CXCR3	P49682	368 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	PFN3	P60673	137 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	STIM1	Q13586	685 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	NR0B2	Q15466	257 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	LINGO4	Q6UY18	593 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	ARL14	Q8N4G2	192 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	WDR48	Q8TAF3	677 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	LMX1A	Q8TE12	382 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	ASB12	Q8WXK4	309 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	NAT6	Q93015	286 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	NPY6R	Q99463	290 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	IL12RB2	Q99665	862 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	BOC	Q9BWV1	1114 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	PIGV	Q9NUD9	493 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	FPGT	O14772	594 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	MUSK	O15146	869 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	EFS	O43281	561 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	DAB1	O75553	588 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	GCAT	O75600	419 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	ZMPSTE24	O75844	475 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	TNFSF15	O95150	251 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	ADCY5	O95622	1261 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	ITGA2B	P08514	1039 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	KRT10	P13645	584 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	PPP1R2	P41236	205 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	CSRP3	P50461	194 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	PDX1	P52945	283 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	SLC20A2	Q08357	652 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	ARTN	Q5T4W7	220 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TCF4-238	ENST00000568169	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		11.6	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms