RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		22.19	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	WASH4P	A8MWX3	477 aa		22.18	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	KDELR3	O43731	214 aa		22.18	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	DFNA5	O60443	496 aa		22.18	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	SKIL	P12757	684 aa		22.18	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	22.18	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	CCT8	P50990	548 aa		22.18	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	22.18	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	22.18	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		22.18	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	22.18	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	SKA1	Q96BD8	255 aa		22.18	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		22.18	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		22.18	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	22.18	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM7	Q9C029	511 aa		22.18	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		22.18	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	22.17	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		22.17	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1B0GTQ1	180 aa		22.17	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PQJ5	194 aa		22.17	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	TLR4	O00206	839 aa		22.17	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	22.17	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM16	O95361	564 aa		22.17	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	22.17	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		22.17	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	SHB	Q15464	509 aa		22.17	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		22.17	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		22.17	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		22.17	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	22.17	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	EPAS1	Q99814	870 aa		22.17	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	ISCU	Q9H1K1	167 aa		22.17	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	22.17	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		22.17	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	CREB3	O43889	395 aa		22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMA2	P25787	234 aa		22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	ITGB7	P26010	798 aa		22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	DNA2	P51530	1060 aa		22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	UBASH3A	P57075	661 aa		22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	NXPH1	P58417	271 aa		22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	TPM4	P67936	248 aa		22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	IQCH	Q86VS3	1027 aa		22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	KLC2	Q9H0B6	622 aa		22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	DYRK4	Q9NR20	520 aa		22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		22.16	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PQU0	124 aa		22.15	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		22.15	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	GSR	P00390	522 aa		22.15	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	PTMS	P20962	102 aa		22.15	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	HTR7	P34969	479 aa		22.15	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF284	Q2VY69	593 aa		22.15	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		22.15	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		22.15	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	22.15	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	PEBP4	Q96S96	227 aa		22.15	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		22.15	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		22.15	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	GDF3	Q9NR23	364 aa		22.15	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		22.15	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		22.15	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	22.14	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	RASA4B	C9J798	803 aa		22.14	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		22.14	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	22.14	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	RASA4	O43374	803 aa		22.14	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	DKK1	O94907	266 aa		22.14	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	DES	P17661	470 aa		22.14	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	NEK3	P51956	506 aa		22.14	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	IL9R	Q01113	521 aa		22.14	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	OVGP1	Q12889	678 aa		22.14	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	CA9	Q16790	459 aa		22.14	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	PARP15	Q460N3	678 aa		22.14	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		22.14	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		22.14	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	HORMAD1	Q86X24	394 aa		22.14	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		22.14	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		22.14	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	HMCES	Q96FZ2	354 aa		22.14	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		22.14	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	CDC6	Q99741	560 aa		22.14	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	KLK13	Q9UKR3	277 aa		22.14	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	22.14	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		22.14	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	22.14	■■□□□ 1.13

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