RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SPPL3Q8TCT6 385 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PLD4Q96BZ4 506 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TCEAL4Q96EI5 215 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CERS2Q96G23 380 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 DHRS4Q9BTZ2 278 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 IL22Q9GZX6 179 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 RXFP1Q9HBX9 757 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ASAH2Q9NR71 780 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PCMTD2Q9NV79 361 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 FAM159BA6NKW6 160 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CCL22O00626 93 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 KRT38O76015 456 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SUN1O94901 812 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 FAM107AO95990 144 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 EPCAMP16422 314 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TSHRP16473 764 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 GEMP55040 296 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CDH4P55283 916 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 NTHL1P78549 312 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CNGA3Q16281 694 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 LGSNQ5TDP6 509 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 LILRA6Q6PI73 481 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CCDC149Q6ZUS6 474 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 LINC00523Q86TU6 105 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CEP295NLQ96MC4 621 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 FAM111AQ96PZ2 611 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 GCNAQ96QF7 691 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SLC46A2Q9BY10 475 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PPCSQ9HAB8 311 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 VPS28Q9UK41 221 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CCL26Q9Y258 94 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 A0A1B0GVM2 712 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TCAF2A6NFQ2 919 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CLDN11O75508 207 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 AVPR1AP37288 418 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 MAPKAPK2P49137 400 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 OXCT1P55809 520 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 DNAJC3Q13217 504 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 BBS7Q8IWZ6 715 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 NDUFAF2Q8N183 169 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 MZB1Q8WU39 189 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TTC17Q96AE7 1141 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 NAT9Q9BTE0 207 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SLC25A51Q9H1U9 297 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 MAN1C1Q9NR34 630 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SENP1Q9P0U3 644 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 GRID1Q9ULK0 1009 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 HMX2A2RU54 273 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 EBAG9O00559 213 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TYROBPO43914 113 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 BNIP3LO60238 219 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PRAMEF11O60813 436 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PPP3CCP48454 512 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 IL9RQ01113 521 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CREMQ03060 361 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 IL10RBQ08334 325 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 MGAT5Q09328 741 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 GALNT3Q14435 633 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 DENND5AQ6IQ26 1287 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 STRA8Q7Z7C7 330 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TMEM135Q86UB9 458 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 KCNMB4Q86W47 210 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 CCNJLQ8IV13 435 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 OTUD6BQ8N6M0 293 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 PAF1Q8N7H5 531 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 WFDC5Q8TCV5 224 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ING5Q8WYH8 240 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 HERVK_113Q902F9 699 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 FETUBQ9UGM5 382 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 ACTL7BQ9Y614 415 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 H3BNC9 293 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-215ENST00000549143 COPEO14579 308 aa8.53□□□□□ -1.04
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