RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547063.5

TRAFD1-203, Transcript of TRAF-type zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRAFD1, Length 867 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1-203ENST00000547063 CEP41Q9BYV8 373 aa16.09■□□□□ 0.17
TRAFD1-203ENST00000547063 SLC25A51Q9H1U9 297 aa16.09■□□□□ 0.17
TRAFD1-203ENST00000547063 DPH5Q9H2P9 285 aa16.09■□□□□ 0.17
TRAFD1-203ENST00000547063 GDF3Q9NR23 364 aa16.09■□□□□ 0.17
TRAFD1-203ENST00000547063 VPS45Q9NRW7 570 aa16.09■□□□□ 0.17
TRAFD1-203ENST00000547063 DUSP12Q9UNI6 340 aa16.09■□□□□ 0.17
TRAFD1-203ENST00000547063 MIA3Q5JRA6 1907 aa16.09■□□□□ 0.17
TRAFD1-203ENST00000547063 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TRAFD1-203ENST00000547063 COL4A2P08572 1712 aa16.08■□□□□ 0.17
TRAFD1-203ENST00000547063 C19orf67A6NJJ6 358 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 MAN2B1O00754 1011 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 TRIM24O15164 1050 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 ATP9BO43861 1147 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 CD160O95971 181 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 SRCP12931 536 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 NFKB1P19838 968 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 DRD1P21728 446 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 IVDP26440 423 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 RPL21P46778 160 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 CSNK1DP48730 415 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 LMAN1P49257 510 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 GALK1P51570 392 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 TERF1P54274 439 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 NRLP54845 237 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 GEMP55040 296 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 SARNPP82979 210 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 SEMA5AQ13591 1074 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 MORF4L2Q15014 288 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 CYTH1Q15438 398 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 IZUMO3Q5VZ72 239 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 TMEM215Q68D42 235 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 WDR93Q6P2C0 686 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 PLPP6Q8IY26 295 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 KCNV2Q8TDN2 545 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 ETNK1Q9HBU6 452 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 HEBP1Q9NRV9 189 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 ANAPC5Q9UJX4 755 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 SHOC2Q9UQ13 582 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 SNX24Q9Y343 169 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 V9GYY5 206 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 SZT2Q5T011 3432 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 PRRT4C9JH25 899 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 METTL18O95568 372 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 IGSF6O95976 241 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 GSRP00390 522 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 MT-CO1P00395 513 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 SERPINF2P08697 491 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 CA4P22748 312 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 PSMB4P28070 264 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 TNFRSF8P28908 595 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 CD68P34810 354 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 MAGEA6P43360 314 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 SOX9P48436 509 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 NUMBP49757 651 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 AP1S1P61966 158 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 RAD51Q06609 339 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 MPP3Q13368 585 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 GRM3Q14832 879 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 ACCSLQ4AC99 568 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 SLC44A4Q53GD3 710 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 C22orf39Q6P5X5 142 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 CEP128Q6ZU80 1094 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 PRUNE1Q86TP1 453 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 CHFRQ96EP1 664 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 ASB2Q96Q27 587 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 NUDCD1Q96RS6 583 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 FOXP3Q9BZS1 431 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 TSPYL1Q9H0U9 437 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 FAM153AQ9UHL3 310 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 STARD13Q9Y3M8 1113 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 AP3B1O00203 1094 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 APRTP07741 180 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 TPSB2P20231 275 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 STK19P49842 368 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 SCNN1BP51168 640 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 ITGA8P53708 1063 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 PRKCQQ04759 706 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 TPSAB1Q15661 275 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 DLG2Q15700 870 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAFD1-203ENST00000547063 FBXO43Q4G163 708 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms