RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 H3BNH8 94 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM24O15164 1050 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 RGS5O15539 181 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 NUDT14O95848 222 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 GLRA2P23416 452 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MATKP42679 507 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 EPS8Q12929 822 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 E2F4Q16254 413 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MPPE1Q53F39 396 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 RAET1GQ6H3X3 334 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 RIT1Q92963 219 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SGF29Q96ES7 293 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PPP3R2Q96LZ3 170 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 DIABLOQ9NR28 239 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PCYOX1Q9UHG3 505 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 INVSQ9Y283 1065 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 WARSP23381 471 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PTPN4P29074 926 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 VAC14Q08AM6 782 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PSMD5Q16401 504 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 POMGNT2Q8NAT1 580 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 IRGQQ8WZA9 623 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ELMO1Q92556 727 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TPD52L3Q96J77 140 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 POMKQ9H5K3 350 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 NFATC1O95644 943 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ALADP13716 330 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TM4SF1P30408 202 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ELK3P41970 407 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TAF13Q15543 124 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 DUSP28Q4G0W2 176 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 FAM228AQ86W67 206 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF786Q8N393 782 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 S100A13Q99584 98 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 APOL2Q9BQE5 337 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 VPS4AQ9UN37 437 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 LOC100653049A0A140TA62 436 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 B4GALT4O60513 344 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MAP3K6O95382 1288 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 IL1BP01584 269 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 VAV1P15498 845 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SELPP16109 830 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ITGAXP20702 1163 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 FMO4P31512 558 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CD86P42081 329 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CRY2Q49AN0 593 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ALFQ53S48 1182 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SLC24A5Q71RS6 500 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 OR52L1Q8NGH7 329 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 BBS2Q9BXC9 721 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ECM29Q5VYK3 1845 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 NCANO14594 1321 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 DDR1Q08345 913 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 BIKQ13323 160 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF549Q6P9A3 640 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CYB5D1Q6P9G0 228 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TPGS1Q6ZTW0 290 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ETNPPLQ8TBG4 499 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MYLPFQ96A32 169 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 BTN2A3PQ96KV6 586 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 V9GYQ6 96 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 EML1O00423 815 aa6.46□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MEIS2O14770 477 aa6.46□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PPIBP23284 216 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
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