RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	PMS2	P54278	862 aa		3.23	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	CDH12	P55289	794 aa		3.23	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	ZXDB	P98169	803 aa		3.23	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	EFR3A	Q14156	821 aa		3.23	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	HNF4G	Q14541	408 aa		3.23	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF284	Q2VY69	593 aa		3.23	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		3.23	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		3.23	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		3.23	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		3.23	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		3.23	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	TMC8	Q8IU68	726 aa		3.23	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		3.23	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		3.23	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		3.23	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	PHF21B	Q96EK2	531 aa		3.23	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		3.23	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		3.23	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	GDA	Q9Y2T3	454 aa		3.23	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	FAM157A	C9JC47	383 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	SLC28A2	O43868	658 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	SOX30	O94993	753 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	TNFRSF8	P28908	595 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	HNF1B	P35680	557 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	THPO	P40225	353 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	HAL	P42357	657 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	PCYT1A	P49585	367 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	LTB	Q06643	244 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	ANKRD1	Q15327	319 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	ME3	Q16798	604 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF585B	Q52M93	769 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	FSCB	Q5H9T9	825 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	TEX45	Q8NA69	505 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	USP38	Q8NB14	1042 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	ELP5	Q8TE02	316 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	NEUROG1	Q92886	237 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM18	Q96B42	140 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	COG8	Q96MW5	612 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	TWNK	Q96RR1	684 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	LHPP	Q9H008	270 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	NOD2	Q9HC29	1040 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	SELENON	Q9NZV5	590 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	WNT16	Q9UBV4	365 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	LRP12	Q9Y561	859 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
MDM2-233	ENST00000545204	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	C4orf47	A7E2U8	309 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	EYA2	O00167	538 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	ADA	P00813	363 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	SERPINC1	P01008	464 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	IL1A	P01583	271 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	CD72	P21854	359 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	DCTD	P32321	178 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	GPR12	P47775	334 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	SLC18A2	Q05940	514 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	SHB	Q15464	509 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	FBXO43	Q4G163	708 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	KLHL22	Q53GT1	634 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	RBFA	Q8N0V3	343 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	MEIS3	Q99687	375 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	PPCS	Q9HAB8	311 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204		A0A096LPK6	155 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	PEX12	O00623	359 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	ASAP2	O43150	1006 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	KLK10	O43240	276 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	ANP32C	O43423	234 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	CHRM4	P08173	479 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	WEE2	P0C1S8	567 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	CENPA	P49450	140 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	ARSF	P54793	590 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	DSC1	Q08554	894 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	PPFIA1	Q13136	1202 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	SLC18A3	Q16572	532 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MDM2-233	ENST00000545204	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		3.2	□□□□□ -1.9

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