RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533817.5

TSTA3-216, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-216ENST00000533817 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
TSTA3-216ENST00000533817 PDLIM2Q96JY6 352 aa15.09■□□□□ 0.01
TSTA3-216ENST00000533817 SP110Q9HB58 689 aa15.09■□□□□ 0.01
TSTA3-216ENST00000533817 IL36AQ9UHA7 158 aa15.09■□□□□ 0.01
TSTA3-216ENST00000533817 SHROOM3Q8TF72 1996 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 MAFKO60675 156 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 PRNPP04156 253 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 CTNNA2P26232 953 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 CDKN2BP42772 138 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 PTGER3P43115 390 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 RHOAP61586 193 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 GBE1Q04446 702 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 GALNT2Q10471 571 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 FAM46CQ5VWP2 391 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 HDDC3Q8N4P3 179 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 OR6K2Q8NGY2 324 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 KIAA1524Q8TCG1 905 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 RUBCNQ92622 972 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 ARRDC3Q96B67 414 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 ZNF599Q96NL3 588 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 HEPHQ9BQS7 1158 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 GPR174Q9BXC1 333 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 NEUROG2Q9H2A3 272 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 SGK2Q9HBY8 427 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 GMEB2Q9UKD1 530 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 FZD4Q9ULV1 537 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 FRYLO94915 3013 aa15.08■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 C10orf142B7Z368 130 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 PLK4O00444 970 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 NDUFS2O75306 463 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 LEFTY1O75610 366 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 PALMO75781 387 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 MAP3K6O95382 1288 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 GKP32189 559 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 MYLK3Q32MK0 819 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 POM121L1PQ3SYA9 428 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 ARSIQ5FYB1 569 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 TMCO4Q5TGY1 634 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 ZNF662Q6ZS27 426 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 ARMCX6Q7L4S7 300 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 NT5DC3Q86UY8 548 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 DCLK2Q8N568 766 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 ATPAF2Q8N5M1 289 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 DEFB119Q8N690 84 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 EXD1Q8NHP7 514 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 GANCQ8TET4 914 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 OMDQ99983 421 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 TSGA10Q9BZW7 698 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 BTBD1Q9H0C5 482 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 DTLQ9NZJ0 730 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 NCDNQ9UBB6 729 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 PIEZO1Q92508 2521 aa15.07■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 APOL1O14791 398 aa15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 NRDCO43847 1150 aa15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 POP4O95707 220 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 SEMA4FO95754 770 aa15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 IGSF6O95976 241 aa15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 CCDC175P0C221 793 aa15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 GARSP41250 739 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 RGRP47804 291 aa15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 PEX5P50542 639 aa15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 ZNF33AQ06730 810 aa15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 SLC10A7Q0GE19 358 aa15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 CNTN1Q12860 1018 aa15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 GSE1Q14687 1217 aa15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 LBRQ14739 615 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 ODF2Q5BJF6 829 aa15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 TFDP3Q5H9I0 405 aa15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 AGBL4Q5VU57 503 aa15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 LYSMD4Q5XG99 296 aa15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 RFX6Q8HWS3 928 aa15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 LRRC49Q8IUZ0 686 aa15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 CADM4Q8NFZ8 388 aa15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
TSTA3-216ENST00000533817 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms