RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519651.5

TSNARE1-204, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-204ENST00000519651 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 RMDN2Q96LZ7 410 aa17.77■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 DCDC2Q9UHG0 476 aa17.77■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 STC2O76061 302 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 LIMK2P53671 638 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 RPS24P62847 133 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 IRX4P78413 519 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 PPM1JQ5JR12 505 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 RABGAP1LQ5R372 815 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 RNF43Q68DV7 783 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 NUDCD3Q8IVD9 361 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 ARMC5Q96C12 935 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 VPS45Q9NRW7 570 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 TCAF1Q9Y4C2 921 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 CAPN7Q9Y6W3 813 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 KIAA0355O15063 1070 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 GLRA3O75311 464 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 VAPBO95292 243 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 SPATA31D3P0C874 917 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 ABCG1P45844 678 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 EPHB3P54753 998 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 CDH4P55283 916 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 OVGP1Q12889 678 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 IL31Q6EBC2 164 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 C16orf46Q6P387 395 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 NECAB2Q7Z6G3 386 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 PGBD5Q8N414 524 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 NPHS2Q9NP85 383 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 TEX28O15482 410 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 PRAMEF11O60813 436 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 MMP2P08253 660 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 SCTRP47872 440 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 PPP3CCP48454 512 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 SEPT6Q14141 434 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 CMC1Q7Z7K0 106 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 TRIM42Q8IWZ5 723 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 TCEAL8Q8IYN2 117 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 FITM2Q8N6M3 262 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 MAGEH1Q9H213 219 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 SNX15Q9NRS6 342 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 INSL5Q9Y5Q6 135 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 CARNS1A5YM72 827 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 ZBBXA8MT70 800 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 FSBPO95073 299 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 TMPRSS15P98073 1019 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 GNA12Q03113 381 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF235Q14590 738 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 CNGA3Q16281 694 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 STXBP5Q5T5C0 1151 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 TMCO4Q5TGY1 634 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 OR7D4Q8NG98 312 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 E2F7Q96AV8 911 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 SPON2Q9BUD6 331 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 ARNT2Q9HBZ2 717 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 TRPC7Q9HCX4 862 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 HAUS2Q9NVX0 235 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 SMPD4Q9NXE4 827 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 USH1CQ9Y6N9 552 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 E2F8A0AVK6 867 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 H0YHG0 523 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 KLF11O14901 512 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 TIMM44O43615 452 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 TSPAN3O60637 253 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 UBOX5O94941 541 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 PPM1AP35813 382 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 SERPINB8P50452 374 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 TNK2Q07912 1038 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 IHHQ14623 411 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 CHI3L2Q15782 390 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 ADGRF1Q5T601 910 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 ATG16L1Q676U5 607 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 OR52K2Q8NGK3 314 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 ARRDC2Q8TBH0 407 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 CYP2S1Q96SQ9 504 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 SEMA3CQ99985 751 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 RETREG1Q9H6L5 497 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 RXFP1Q9HBX9 757 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-204ENST00000519651 SIRPGQ9P1W8 387 aa17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms