RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516655.1

RN7SKP70-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 70, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP70, Length 271 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP70-201ENST00000516655 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 DUX1O43812 170 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 ATP9BO43861 1147 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 PFKFB2O60825 505 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 GCATO75600 419 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 PRNPP04156 253 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 COX6B1P14854 86 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 TSHRP16473 764 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 STAT1P42224 750 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 STAT5AP42229 794 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 GPR3P46089 330 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 THOP1P52888 689 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 PLK1P53350 603 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 LIMK2P53671 638 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 AP3M2P53677 418 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 MAP3K7CLP57077 242 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 PPARDQ03181 441 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 PEX6Q13608 980 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 CDH18Q13634 790 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 C16orf72Q14CZ0 275 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 CHRNA6Q15825 494 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 MAP9Q49MG5 647 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 TTC38Q5R3I4 469 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 MTFR2Q6P444 385 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 CLEC20AQ6ZU45 233 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 KCNK18Q7Z418 384 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 SCD5Q86SK9 330 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 OR4D9Q8NGE8 314 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 FRS2Q8WU20 508 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 RNF34Q969K3 372 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 RAB7BQ96AH8 199 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 AK8Q96MA6 479 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 NOX5Q96PH1 765 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 ACCSQ96QU6 501 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 SLC25A23Q9BV35 468 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 STRA6Q9BX79 667 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 EDEM3Q9BZQ6 932 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 PDE11AQ9HCR9 933 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 FBXO8Q9NRD0 319 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 C5AR2Q9P296 337 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 COPG2Q9UBF2 871 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 KLF15Q9UIH9 416 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 NME7Q9Y5B8 376 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 STAB1Q9NY15 2570 aa6.5□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 POM121BA6NF01 834 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 K7EM74 188 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 MDM4O15151 490 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 TBL1XO60907 577 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 NADKO95544 446 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 CPA1P15085 419 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 PRLRP16471 622 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 NFKBIAP25963 317 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 HK3P52790 923 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 ITGA1P56199 1179 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 SGCGQ13326 291 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 NNTQ13423 1086 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 TRPC3Q13507 836 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 ARHGEF7Q14155 803 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 ZNF235Q14590 738 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 NR6A1Q15406 480 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 ZNF174Q15697 407 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 TMEM119Q4V9L6 283 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 ZNF542PQ5EBM4 170 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 VWA2Q5GFL6 755 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 BMP2KLQ5H9B9 411 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 PM20D1Q6GTS8 502 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 KYQ8NBH2 561 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 SLC2A14Q8TDB8 520 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 ARHGEF26Q96DR7 871 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 MTG2Q9H4K7 406 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 OLFML3Q9NRN5 406 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 SLC39A1Q9NY26 324 aa6.49□□□□□ -1.37
RN7SKP70-201ENST00000516655 TBC1D7Q9P0N9 293 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms