RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516259.1

RNU6-390P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 390, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-390P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-390P-201ENST00000516259 PKP1Q13835 747 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 GALNT3Q14435 633 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 CRYMQ14894 314 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 DPCR1Q3MIW9 517 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 DUSP28Q4G0W2 176 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF667Q5HYK9 610 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 HMBOX1Q6NT76 420 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 AAGABQ6PD74 315 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 CYB5R4Q7L1T6 521 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 RNF144BQ7Z419 303 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM160B2Q86V87 743 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 GHDCQ8N2G8 530 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 GALNT16Q8N428 558 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 SCFD2Q8WU76 684 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 KIF1BPQ96EK5 621 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 PGAM5Q96HS1 289 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 FEM1CQ96JP0 617 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 PIMREGQ9BSJ6 248 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 HIPK3Q9H422 1215 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 MLXIPLQ9NP71 852 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 ASAH2Q9NR71 780 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 C20orf141Q9NUB4 165 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 KCNE2Q9Y6J6 123 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 GAGE12JA6NER3 117 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 C2CD4BA6NLJ0 364 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 LRRC53A6NM62 1247 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 A8MZ25 164 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 USP17L23D6RBM5 183 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 KIR2DS3K7RE56 304 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 LDLRAD4O15165 306 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 PLOD3O60568 738 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 CSPG5O95196 566 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 IGLV2-14P01704 120 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 PRKCGP05129 697 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 PCNAP12004 261 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 ST6GAL1P15907 406 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 CDAP32320 146 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 ICAM3P32942 547 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 RYKP34925 604 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC16A2P36021 539 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 CLCNKBP51801 687 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 ARSFP54793 590 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 RPS13P62277 151 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 NUCB1Q02818 461 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 PGM5Q15124 567 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 TAF11Q15544 211 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 EDRF1Q3B7T1 1238 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM154Q6P9G4 183 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 DBX2Q6ZNG2 339 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM57BQ71RH2 274 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 KDELC2Q7Z4H8 507 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 GALNT5Q7Z7M9 940 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 HACE1Q8IYU2 909 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 ADGRF2Q8IZF7 708 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM116Q8NCL8 245 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 MCPH1Q8NEM0 835 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 DNAAF1Q8NEP3 725 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 BICD2Q8TD16 824 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 SNAPC3Q92966 411 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF333Q96JL9 665 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 KLHL15Q96M94 604 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 PIP5K1AQ99755 562 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM118BQ9BPY3 351 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 SDF4Q9BRK5 362 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 TUBB6Q9BUF5 446 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 IL17RBQ9NRM6 502 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 BABAM1Q9NWV8 329 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 ASB6Q9NWX5 421 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 FLRT1Q9NZU1 646 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 NLKQ9UBE8 527 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC8A2Q9UPR5 921 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 DMRT1Q9Y5R6 373 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-390P-201ENST00000516259 A0A096LPK6 155 aa3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms